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基于SVM的microRNA计算识别方法
计 算 机 与 现 代 化
2012 11 JISUANJI YU XIANDAIHUA 207
年第 期 总第 期
文章编号:1006-2475 (2012)11-0030-03
基于SVM 的microRNA 计算识别方法研究
,
孙萧寒 赵 维
( , 7 14000)
渭南师范学院数 学与信息科 学学院 陕西 渭南
:microRNA( miRNA) 19-24nt RNA ,
摘要 简称 是近年来发现的一类新的长约 的 内源性非编码 在动物和植物 中发挥着重要
而广泛的调控功能。它的发现主要有 cDNA 克隆预测和计算发现 两条途径 。由于 cDNA 克隆预测方法受 miRNA 表达的
, , miRNA 。
时间和组织特异性 以及表达水平的影响 而计算发现 可 以弥补其 不足 因此 的计算方法受到 了广泛的重视 支
, miRNA 。
持 向量机作为一种优异 的机器学习方法 因其良好的主动学 习能力可应用于 的预测 本文利 用支持向量机方法
miRNA , , 。
对线 虫 进行预测 结果表明 该方法具有 良好的正确率和敏感性
关键词:miRNA; SVM; 机 器学习; 生物信息学
中图分类号:TP301. 4 文献标识码:A doi: 10 . 3969 /j . issn. 1006-2475 . 2012 . 11. 008
Computational Method for Identification of microRNA Based on SVM
SUN Xiao-han ,ZHAO Wei
(College of Mathematics and Information Science ,Weinan Normal University ,Weinan 7 14000 ,China)
Abstract :microRNA (miRNA)is an endogenous non-coding RNA which is discovered in animals and plants. The length of
miRNA is about 19-24nt. miRNA plays an important role and extensive functions in animals and plants. miRNA has two ways ,
cDNA clones predict and calculating found are the two ways for the miRNA discovery. cDNA clone predict method has some
shortcoming
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