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人工免疫小生境聚类程序
clc
clear all
saw=load(ywh.txt);
saw0(:,1:2)=saw(:,3:4);
k=3;
[m n]=size(saw0);
ma=max(saw0);
mi=min(saw0);
for i=1:m
sa(i,:)=(saw0(i,:)-mi)./(ma-mi);
end
Size=1000; %? 初始代码容量
FG=500;%样本集
BG=50;%解集
BT=100;%优秀
SG=400;%子代
se=0.01;
CodeL=15;%二进制长度
P=k*n;
E=round(rand(Size,P*CodeL));%初始代码库
count=0;
for i=1:FG
cn=fix(rand*Size);
if cn==0
cn=cn+1;
end
father(i,:)=E(cn,:);
end
for i=1:50
[fag]=father2binfun(father,FG,P,CodeL);%转换成十进制解
[bestan,best,bf,zbf]= computfun(sa,fag,FG,k,m,n);%最优解,最优指标,解集,指标值
sl=0.2;
[zbf]=xshfun(fag,zbf,sl,k,n);
[father]=aiafun(fag,zbf,BG,FG,P,CodeL);%淘汰克隆转换成二进制,变异
end
[fag]=father2binfun(father,FG,P,CodeL);;%转换成十进制
[bestan,best,bf,zbf]= computfun(sa,fag,FG,k,m,n);%bestan,
xk=bestan;
lesa=zeros(k,m);
for i=1:m
du=zeros(1,k);
for j=1:k
dup(j,:)=sa(i,:)-xk(j,:);
du(1,j)=sum(dup(j,:).^2);
end
dmi=min(du);
df=find(dmi==du);
lesa(df,i)=i;
end
function [fag]=father2binfun(father,FG,P,CodeL)
for i=1:FG
cnc=0;
for j=1:P
cnc=(j-1)*CodeL+1;
cnl=j*CodeL;
temp=father(i,cnc:cnl);
fag(i,j)=0;
for jk=1:CodeL
if temp(1,jk)==1
fag(i,j)=fag(i,j)+1/(2^(jk-1));
end
end
if fag(i,j)=1
fag(i,j)=fag(i,j)-1;
end
end
end
function [bestan,best,bf,zbf]=computfun(sa,fag,FG,k,m,n)
lesa=zeros(k,m);
zbf=zeros(FG,1);
for i=1:FG
ax=zeros(k,n);
cnc=0;
for jk=1:k
cnc=(jk-1)*n+1;
cnl=jk*n;
ax(jk,:)=fag(i,cnc:cnl);
end
sup=zeros(1,m);
for jm=1:m
dop=zeros(1,k);
for jk=1:k
for jn=1:n
dop(1,jk)=dop(1,jk)+(sa(jm,jn)-ax(jk,jn))^2;
end
dop(1,jk)=sqrt(dop(1,jk));
end
sup(1,jm)=min(dop);
end
mup=zeros(k-1,1);
for ik=1:k-1
hk=ik;
for io=(ik+1):k
temp=0;
for jn=1:n
temp=temp+(ax(hk,jn)-ax(io,jn))
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