多重连接依赖性探针扩增技术在产前诊断中的应用.docVIP

多重连接依赖性探针扩增技术在产前诊断中的应用.doc

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多重连接依赖性探针扩增技术在产前诊断中的应用

精品论文 参考文献 多重连接依赖性探针扩增技术在产前诊断中的应用 刘青松1, 2 朱兴春1, 2 唐中1, 2 (通讯作者) (1川北医学院医学检验系 四川南充 637000;2川北医学院附属医院检验科 四川南充 637000) 【中图分类号】R319 【文献标识码】A 【文章编号】2095-1752(2012)03-0135-03 产前诊断是在遗传咨询的基础上,主要通过遗传学检测和影像学检查,对高风险胎儿进行明确诊断,通过对患胎的选择性流产达到胎儿选择的目的,从而降低出生缺陷率,提高优生质量和人口素质。多重连接依赖性探针扩增(MLPA)技术是在多重扩增探针杂交(MAPH)技术的基础上改进而来,基本原理是针对基因组内拷贝数变异(CNV)对可与样本DNA正确杂交并被连接酶连接的探针进行扩增和半定量分析,具有精确度高、重复性好、操作简便及通量大等特点。MLPA已广泛应用于染色体数目异常、遗传性疾病基因缺失重复、单核苷酸多态性、甲基化等多个研究领域等。随着MLPA不断被改进,目前已成为临床上常用的产前诊断工具之一,因此本文就其在产前诊断中的应用做一总结。 1 MLPA原理 MLPA是集DNA杂交技术、PCR技术、连接酶反应技术和毛细管电泳技术与一体,具有高特异性、高灵敏性和高通量的一种分子生物学技术。MLPA最大特点在于探针的设计。探针包括两个长短不一的荧光标记寡核苷酸片段。短探针(5 端探针)为化学合成而来,长约50-60bp,包括一段3端与靶序列完全互补的杂交序列和一段5 端长19 nt的共同PCR上游引物互补序列。长探针(3端探针)是经M13噬菌体衍生法制备而来,长约60-450bp,包括一段5端与靶序列完全互补的杂交序列和一段3端23nt共同PCR下游引物相互补序列及一段长度不一的中间填充序列。由于填充序列长短不一,连接后总长度在130 nt-480nt之间,相邻两探针扩增产物长度相差6-9 nt,因而能在一个反应体系中,仅用一对引物即可扩增达45个不同的核苷酸序列。由此可见,MLPA所得到了产物不是直接针对原始样本中存在的序列,而是由两条探针经连接反应形成的片段。连接反应高度特异,只有当两个探针与靶序列完全杂交,连接反应才能进行,如果靶序列与探针序列不完全??补,即使只有一个碱基的差别,就会导致杂交不完全,使连接反应无法进行。当连接反应完成,随后进行PCR扩增,产物经毛细管电泳,收集相应扩增峰。如果检测的靶序列发生突变、缺失或扩增,相应探针的扩增峰便会消失、降低或增加,因此,根据扩增峰的改变就可判断靶序列是否有拷贝数的异常或突变存在。 2 MLPA 在产前诊断中的应用 2.1 胎儿染色体非整倍体检测 染色体非整倍体改变在临床上十分常见,传统的检测方法有胎儿标本的核型分析和荧光原位杂交技术。然而核型分析具有细胞培养周期长,甚至培养失败而得不到分析结果的风险;荧光原位杂交技术价格高,且只能针对部分染色体。MLPA作为新发展的产前诊断技术代表,因其具有分析周期短、高通量等特点,在其发展初期就应用于临床,尤其是对非整倍体变异的检测。Slater [1], Hochstenbach[2]和Gerdes [3]就采用商业化MLPA SALSA P001试剂盒对非整倍体进行产前诊断。最近,vanOpstal [4], Gerdes[5], Kooper[6,7]和 Boormans [8]采用商品化MLPA P095试剂盒对10110分未经培养的羊水标本和2525份绒毛标本进行13, 18, 21, X和Y 染色体拷贝数进行分析。发现MLPA不仅可对非嵌合体变异能够做出准确诊断,对于部分三体的嵌合体变异也能做出相应的检出。国内,江雨[9]等采用MLPA技术对179例羊水、90例脐带血和13例绒毛标本进行13号、18号、21号和X、Y染色体进行检测,共发现染色体异常标本17例,其中21三体7例、18三体5例、45,X单体3例、13三体1例和47, XYY三体1例。 2.2 先天性心脏病检测 先天性心脏病是常见的胎儿临床表现,其发病机制复杂,涉及基因众多。目前,临床对先天性心脏病的诊断是通过经胸心脏彩色超声、胸部x线、心电图以及临床症状和体征进行诊断。这些方法可以帮助判断畸形部位或脏器功能,但不能提供病因学方面的信息,也无法对再次妊娠的风险进行精确评估。因此有必要对先天性疾病的靶基因进行进一步的检测。Jeroen [10]等采用MLPA技术对与先天性心脏病有关10q23.2.q23.31微缺失进行检测,并确定了BMPR1A为主要效应基因。该研究团队认为BMPR1A的缺失与房室间隔缺损相关。国内,陈瑛 [11]

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