vector NTI教程 第二章　数据库建立和储存序列.pdf

第二章 数据库建立和储存序列 第二章　数据库建立和储存序列 　 在了解主程序的样子之后，接下来必须要先了解NTI 的数据是如何储存和读取， 并且建立自己的序列数据库。在NTI 的程序中会有一个内建好的数据库，同时把 存盘的路径预先设定在数据库的位置之中。我们自身主机的数据库叫做Local Database ，同时NTI 提供了数据库分享的功能，可以透过网络和其他主机交换或 分享序列数据。 　 如何建立自己的数据库？首先在主程序下点选 （Local Database ）开启 数据库， 为分享和交换数据库的指令。Local Database 开启后会看到下面 图示( 图2.1) ： 图2.1 使用Local Database 开启数据库 　 进入数据库后会先看到右手边的窗口有一大堆数据，那是程序事先内建好的 序列数据，可以直接点选开启。数据库会因为序列的性质不同而有不同的归类， 想要看不同的类别可以在左上角选择。 5 Vector NTI 教育及训练手册 图2.2 建立数据库 　 接下来要建立属于自己的数据库了，以斑马鱼的基因序列为例，第一步在 DNA/RNA Molecules ( 图2.2) 的项目下点选 后会在Invitrogen vectors 下方出现 一个Group1 的文件夹，可以自己改名。在新的文件夹项目下再点选 ，会跳 出一个窗口( 图2.3) ： 图2.3 新建数据库 　 旁边的字段可以输入名称，接着点选DNA/RNA Molecule( 图2.4) ： 6 第二章 数据库建立和储存序列 图2.4 新的DNA/RNA 模块 　 　 　 在此项目下可以选择序列的特性，这些项目的选择会影响到主程序的分析和 图谱形状，可以依照序列的特性设定。 　 接着再点选Sequences and Maps: 图2.5 编辑斑马鱼海大基因的序列 　 在此窗口( 图2.5)下，我们就将要加载的序列先全选后再按复制，之后在这窗 口下点选Paste 后就可以贴入序列。