蛋白质折叠与细胞内的蛋白质折叠.ppt

核糖核酸酶 变性因素 蛋白质变性后： 复性 脯氨酸残基紧紧地结合在结合沟的疏水口袋中，并且羧基端氧原子与蛋白质的的碱性侧链形成氢键，肽片段与疏水环境的结合，通过减少肽基团的电荷分离而促进了顺反异构化作用，并产生了具有单键特征的肽键，同时与Cyclophilin 的紧密疏水相互作用，可使肽基团的几何学上变形产生异构化作用这两种机理或它们的组合将减少绕肽键转动的能垒。此能量是顺反异构化所必需的 三、分子伴侣(Chaperone) 非折叠蛋白含有大量的暴露于溶剂的疏水区域，并因此有形成分子内和分子间聚集的倾向。分子伴侣就是一类具有阻止不正确的折叠或修正不正确折叠的蛋白质，尤其是对于多结构域蛋白和多亚基蛋白的不正确折叠分子伴侣起着极其重要的作用 在细胞内分子伴侣并不催化二级结构的形成，而是在蛋白质知折叠的过程中，去识别和稳定部分折叠的中间物，使肽链进行装配和去装配。它们是通过与非折叠或聚集多肽的暴露于溶剂的疏水表面结合并逐步释放它们来达到此目的 图4-7 大肠杆菌PapD蛋白的晶体结构 PapD是一个促进毛发蛋白合适组装的分子伴侣，但不是它的组成部分。分子伴侣与毛发蛋白亚基C 端的一个19 肽的保守肽段的复合物的结构 PapD 蛋白由两个结构上相似的结构域组成。球状CPK 模型表示的是毛发蛋白的保守多肽。该多肽与PapD 蛋白的G1b链结合并显示伸展的构象。多肽链与蛋白之间以氢键连接，多肽链末端的羧基锚在PapD 蛋白的两个结构域的接点的分叉上，并通过氢键与蛋白的不变残基Arg8(R8)和Lys112(K112) 残 基结合，PapD 的突变研究表明这些残基的突变将使其丧失与毛发蛋白亚基结合的能力。G1b链的保守疏水残基以绿色表示。从图中我们可看到PapD 蛋白有一个宽的裂缝，此裂缝含有几个保守的暴露于溶剂的疏水残基这些残基在功能上是专一性地与PapD 的靶肽片断结合 Chaperones are a class of proteins which bind to incompletely folded or assembled proteins in order to assist their folding or prevent them from aggregating. Crystal structure of human Hsp90-alpha.PDB:2h55 Crystal structure of the carboxy-terminal domain of htpG, the E. coli Hsp90 PDB:1sf8 Crystal Structure of the Middle Domain of HtpG, the E. coli Hsp90 PDB:2gq0 Crystal Structure of the N-terminal Domain of HtpG, the Escherichia coli Hsp90, Bound to ADP PDB:2IOR * 第三章:蛋白质折叠 第四章: 细胞内的蛋白质折叠 第三章:蛋白质折叠 一、蛋白质复杂的三级结构信息贮存于氨基酸序列中 关于氨基酸序列与蛋白质空间结构的关系研究，最早的工作是由C.Anfinsen (1960)关于核糖核酸酶的研究工作他研究了核糖核酸酶的去折叠和重折叠过程。该酶是由124 个氨基酸组成的蛋白质有四对二硫键，其组合有105{[(2 4)!/24 4!]=105}种的可能方式。当用还原剂如b-巯基乙醇(HOCH2-CH2-SH)作用时二硫键被部分还原，继续加大b-巯基乙醇的量，二硫键可全部被还原。用8 M 的脲加b-巯基乙醇处理，多肽链分子内四对二硫键可全部被还原，肽链伸展为无规卷曲，酶活性完全丧失。但如果将脲和b-巯基乙醇透析掉并在空气中进行氧化，多肽链可又重新折叠为一个具有特定的三维结构和催化活性的酶，它与未经处理的酶具有相同的溶解度并可结晶并获得相同的X-射线衍射图，其吸收光谱也相同。 这是一个很好的蛋白质一级结构序列决定其三维结构的例子即顺序决定构象 二、关于蛋白质折叠的理论模型 各种实验及理论计算均证明蛋白质的天然构象在热力学上是最稳定的 1、 框架模型(Framework model): P. S. Kim 和R. L. Baldwin 于1982 年提出了蛋白质折叠的框架模型。该模 型认为，在蛋白质折叠的过程中大约有15 个氨基酸残基的多肽链首先折叠为瞬态的a螺旋或b片层结构的二级结构单元，然后这种瞬态的结构通过扩散彼此接近形成aa ab 或bb的复合结构而获得稳定这种复合结构，又称为折叠单元，折叠单元作为一个核心，吸引和稳定其它摆动着的二级结构单元形成折叠框架其它的侧链将适应这个框架。 2 疏