大黄鱼线粒体DNA控制区遗传多样性分析.pdfVIP

第 49卷 第 3期 厦r1．大学学报 (自然科学版) Vo1．49 No．3 2010年 5月 JournalofXiamenUniversity(NaturalScience) May2010 · 研究简报 · 大黄鱼线粒体 DNA控制区遗传多样性分析 毛 勇，蒋秋芬，曾华嵩，王 军 (厦 门大学海洋与环境学院，福建 厦 门361005) 摘要 ：采用PCR—DNA测序技术测定、分析了闽～粤东族、岱衢族大黄鱼群体47个个体的线粒体DNA控制区基因序 列．结果表明：所获序列长度为 786~799bp，具 32个碱基替换位点和 41个插入 ／缺失位点；控制区碱基组成中T、C、A、 G含量分别为 31．9 、15．8 、29．3 和 23．0 ，平均转换颠换比(R)5．5；共有 10个单倍型，闽一粤东族 8个和岱衢族 3 个，仅 Hap03为共享单倍型；所有个体的平均单倍型多样性 (Hd)为 0．470，核苷酸多样性(P)为 0．00650；2个群体的遗 传距离 (D)为0．00713，遗传分化指数 (Fst)为0．1816，基因流(Nm)为 1．13．群体遗传分析结果表明，闽一粤东族、岱衢 族大黄鱼野生群体遗传变异处于较低水平 ，闽一粤东族大黄鱼的遗传多样性水平稍高于岱衢族，群体间的遗传分化不明 显． 关键词 ：大黄鱼；闽一粤东族；岱衢族；遗传多样性 中图分类号 ：Q347 文献标识码 ：A 文章编号 ：0438—0479(2010)03—0440—05 大黄鱼 (Pseudosciaenacrocea (Richardson))隶 结构 ，为大黄鱼的资源保护和种质改 良提供 了参考资 属鲈形 目(Perciformes)鲈亚 目(Percoidei)石首鱼科 料． (Sciaenidae)黄鱼属 (P5P“d0sc口P口)，属于亚热带集 群性近海鱼类，分布于黄海 中部以南至琼州海峡 以东 1 材料与方法 的中国大陆近海及朝鲜西海岸 ，雷州半 岛以西也偶有 发现．根据大黄鱼的外部形态和生态地理学特征 ，田明 1．1 实验材料 诚等L1把我国沿海大黄鱼分为 3个地理种群 ：岱衢族 ， 采集野捕大黄鱼子一代养殖个体 47尾 ，其中闽一 分布于黄海南部至东海 中部，包括 吕泗洋、岱衢洋、猫 粤东族 24尾 ，全长 17．2～22．0mm，2008年 4月 28 头洋、洞头洋至福建嵛 山岛附近 ；闽一粤东族 ，主要分 日取 自福建宁德城澳养殖 网箱 ；岱衢族 23尾 ，全长 布在东海南部 、台湾海峡和南海北部 (嵛山岛以南至珠 16．7～21．5mm，2008年 4月 20日取 自浙江象 山黄 江口)；硇洲族 ，主要分布于珠江 口以西至琼州海峡 的 避岙养殖网箱． 南海区．20世纪 7O年代以来，由于过度捕捞导致野生 1．2 大黄鱼总 DNA提取 大黄鱼数量急剧减少 ，种质资源的遗传组成趋 向同质 取鱼体背部肌 肉于 95 乙醇 ，～2O℃保存．参考 化 ，遗传多样性水平降低[2-53． Sambrook等[g]的常规酚一氯仿一异戊醇方法提取大黄 线粒体 DNA(mitochondrialDNA，mtDNA)以其 鱼总 DNA，--20℃下保存备用． 较快 的进化速率、较高的拷贝数 、严格的母系遗传等优 1．3 大黄鱼mtDNA控制区基 因的PCR扩增 势特征已经成为群体遗传学和分子系统学研究的重要 工具之一 ，其中控制区(controlregion)序列 因其进化