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miRNA分析研究进展 李都悦 ，黄伊子 1,3，刘 伟 ，周 玮 1,2,3 (1．湖南农业大学植物保护学院植物病虫害生物学与防控湖南省重点实验室，湖南 长沙410128； 2．湖南省烟草公司郴州市公司，湖南 郴州423000；3．湖南农业大学湖南省生物农药与制剂加工 工程技术研究中心，湖南 长沙410128) 摘 要 ：介绍了miRNA的形成、调控机理、在生物体内的含量等内容，总结了目前用于miRNA分析的三种方法 RT—PCR、DNA芯片和 RNAsequencing(RNA—seq)，并分析了其优缺点及适用范围，最后提出了miRNA的预测软件的原理及使用困难等。 关键词：miRNA；形成；调控机理；含量；分析方法；预测；综述 中图分类号：Q74 文献标识码：A 文章编号：1006—060X (2014)16-0014—04 ProgressinmiRNA Research LIDou．3rue0。HUANGYizil’3．LIUWei ．ZHOUWei0， L1．HunanKeyLaboratoryforBiologyandControlofHantDiseasesandInsectPests，Cotk ofPlantProtection,HunanAgricultural University,Changsha410128,PRC；2．ChenzhouCompany，HunanT0bⅡccoCorporation,Chenzhou423000,PRC；3．Hunna Engineering TechnoloygResearchCenterforBiopesticidenadPhramaceuticProcessing,HunanAgricuhuralUniversity,Chnagsha410128，PRC) Abstract：Thispaperintroducestheformation，regulationmechanism anddistributionofmiRNA inorganisms，discussescurrentthree methodssuchasqRTP·CR，DNAmicroarrayandRNAsequencing(RNA—sect)formiRNAanalysisontheiradvantages，disadvantagesand scopeofapplication，andfinaltyputsforwordtheprincipleandusedefectsofthemiRNApredictionsoftware． Keywords：miRNA；formation；reug lationmechanism；content；analysismethod；prediction；review MicroRNA (miRNA)是一类 内生的、长度约为 或前体先由miRNA的编码基因转录形成初级miRNA 20～24个核苷酸的小分子RNA，调控着生物体基因的表 (Pri—miRNA)，其长度通常大于 100bp(有时甚至有几百 达水平，是基因表达网络的关键调控因子。一个miRNA bp)，且带有一个或多个茎环结构，经Drosha与DGCR8 可以调控多个靶基因，也可以由多个miRNAs来调控同 两种酶剪切后形成带发夹与茎环的miRNA前体结构 一 个基因的表达。在生物体患病时，miRNA还可用作鉴 (pre．miRNA)，然后通过Expo~in5酶将前体运送至核 定疾病的生物标签。学者们在不同的生物体中发现了各 外，接着经Dicerl酶和TABP2酶作用剪去发夹环形成 种功能性miRNAt“。例如：1993年Lee等圈在秀丽隐杆线 双链结构，之后双链解开。其中，一条链即成熟miRNA 虫中发现一个可持续调控胚胎后期发育的基因lin．4； 链，与靶mRNA的3’非翻译区(uTRs)结合形成双链被 2000年 Reinhart等口]发现了具有转录后调节功能的小分 称为沉默复合体(RISE)；而另一条称为星号链。RIS