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基于SSE2的高性能串匹配算法研究水 蛾正华．徐琳，冯圣中 中国科学院计算技术研究所 {dzII；xuIin；fsz}@ncic．∽．cn 摘要：字符串的模式匹配性能的提高会给众多相关领域带来巨大的影响，本文选取了最常应用 的字符串模式匹配算法一朴素串匹配算法进行基于SSE2的优化，结果表明，基于SSE2的模 式匹配算法性能明显好于C语言提供的strStr()函数．如何有效利用数据局部性是提高程序性能 的一条关键因素，如何将数据快速装入xMMS寄存器是该算法要解决的一个主要问题． 1引言 字符串的模式匹配性能的提高会给众多相关领域带来巨大的影响，如多媒体内容分析与检 索、生物信息处理等应用．需要频繁使用字符串的模式匹配算法。目前对串行串匹配算法的研究 已经相对成熟。对并行串匹配算法的研究主要集中在如何对其进行线程级、任务级的并行化以期 在并行系统中能得到良好应用。目前高性能软件主要应用在大型并行系统中。故对高性能算法、 高性能软件的研究也主要集中在如何发掘算法的线程级、任务级的并行性。为了获得更高的性 能，需要根据运行平台的不同对程序进行改进，以牺牲通用性为代价来获得性能的提高。 SIMDExtensions SsE2(Stre锄ing 2)是InteI为提高处理流媒体的性能而推出的多媒体向量指令 集。目前，SSE2在数字图像处理、视频处理、音频处理等多媒体处理领域已得到广泛应用。将这 种指令集应用到字符串的模式匹配问题中．充分挖掘该算法的数据局部性．在指令级并行优化原 来的串行算法．将可以大幅度提高计算速度，最好情况下甚至可以提高十多倍。本文首先分析了 gIibc库函数s仃s呱)的特点．利用SSE2指令重写了这种算法，并分析了适合这种算法的数据特征。 2st璐tro函数与SSE2指令集 g】ibc库函数s仃S砥)采用朴素串匹配算法。其C语言描述如下： ch盯‘stnnatch(char’subject，ch盯’qua巧) { int iJ，k； int m=strlen(qua叮)；／／模式串长度 int n=s仃Ien(subject)；／／目标串长度 f0“i-0；i=n·m；i++) { j=O；k=i； while(jmsubject【k】==qua哆【i】) {k++．J++；} 69 i坟j==m)retumchar宰(subject+i)；／／i为有效位移，否则查找下一个位移 )／／cndfor remm．1：／／找不到有效位移。匹配失败 } 其算法复杂度为O(mn)．理论上朴素匹配算法性能远差于KMP、Boyer 间复杂度为o(I(ft))等算法。但由于在具体应用中，最坏情况是极少出现的，大多数应用中若前，个 字符匹配，则整个模式串匹配的概率远大于砌。而模式串的长度远小于目标串的长度，朋小于或 较好的性能：将模式串第一个字符a、第二个字符b存于寄存器中。从目标串中快速寻找与ab匹配 的位置x，肌+2处继续匹配，若成功则返回，不成功触+l处继续寻找与ab匹配的位置。直到结 束。 1997年，Intel 数(doubIe set、store)，其他指令(shift、pack、岫pack、shu用e)。 3基于SSE2的串匹配算法 在工作过程中。遇到一类特殊应用，模式串的长度为“位或128位。针对这种特殊应用，用 SSE2指令实现了串匹配算法，取得了良好的效果。为了提高程序执行效率，算法实现采用内嵌汇 编方式。 算法思想：每次从目标串中取出16字节，作为一个整体，利用SSE2指令，与模式串进行匹 配。这样，理论上，对于长度为16字节的模式串，其时间复杂度可由原来的16×力降到，，。 下面是算法的C语言描述： strmacchsse2(char+psubjectchar·qua秽) { —-m128dnmpl28d，mql28d，iql28d；