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焦磷酸测序定量检测宫颈组织LMX1A基因甲基化水平的临床意义
精品论文 参考文献
焦磷酸测序定量检测宫颈组织LMX1A基因甲基化水平的临床意义
王立锋1 朱昊平2 夏子茵1 徐 军1通讯作者
1.上海市闵行区中心医院妇产科 上海 201199;
2.上海市计划生育科学研究所 上海 200032
【摘 要】目的:检测LIM同源盒转录因子1ɑ基因(LMX1A)基因在不同程度病变组中宫颈组织中的甲基化水平,评估其作为宫颈上皮细胞癌变的分子标志物的诊断价值。方法:使用焦磷酸测序法检测每个抑癌基因的甲基化情况。比较正常组织和不同程度病变组织的甲基化水平的的差异。采用利用受试者工作特性曲线(ROC)确定癌变组与非癌变组之间的判别临界值。结果:宫颈癌中的LMX1A基因6个位点的甲基化平均水平为14.36%, 明显高于HG-CIN病变 的4.70%、LG-CIN病变的5.05%和NLM的4.53% (Plt;0.01)。检测LMX1A基因甲基化甲基化鉴别宫颈癌的ROC曲线下面积分别为0.603,敏感度与特异度之和的最大值所对应的界定值为10.66%,诊断浸润性宫颈癌的的敏感度为37%、特异度95%。结论:定量分析宫颈组织中LMX1A基因甲基化将有可能作为分子标志物用于浸润癌的鉴别中。
【关键词】LIM同源盒转录因子1ɑ基因;DNA甲基化;宫颈癌;焦磷酸测序法
【中图分类号】R737. 33 【文献标识码】B 【文章编号】1674-8999(2015)8-0243-02
Quantitative analysis of LMX1A methylation for differentiation on cervical cancers and precursors
Wang Lifng 1 ,Zhu Haoping2, Xia Ziyin1, XU Jun1*,
(1. Department of Obstetrics amp; Gynecology, Central Hospital of Minhang District, Shanghai,201199,China)
(2. Shanghai Institute of Planned Parenthood Research,Shanghai,200032,China)
Correspondence to:Xu Jun E-mail:xujun1958@
Funded by: Shanghai Health Bureau Project
【Abstract】Objective:To estimate a quantitative measure of LMX1A methylation in detection of cervical cancer. Methods:The percentage of LMX1A methylation was tested by pyrosequencing in different level of lesions. The efficacy of LMX1A in diagnosis of cercical cancer was tested by ROC curve. Results:The mean methylation value of the LMX1A gene in ICC were 14.36%, significantly higher than that in HG-CIN (4.70%), LG-CIN (5.05%) and NLM (4.53%) (Plt;0.01). The area under the ROC curve (AUC) was 0.603 for LMX1A gene methylation The optimal cut-off value for LMX1A gene methylation was set at 10.66% with the sensitivity of 37% and specificity of 95%. Conclusion:Quatitative measurement of LMX1A by pyrosequencing in cervical caner scraping is highly sensitive and it may have a potential value for diagnosis of cervical cancer in clinic.
【Key-words】LMX1A; DNA methylation; Cervical cancer; Pyrosequencing
宫颈癌的发病率和死亡率分
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