因特网上分子生物学的信息资源研究.pdfVIP

第四届海峡两岸科技信息交流研讨会论文集 因特网上分子生物学的信息资源 李秉鸿 (广西兽医研究所，南宁530001) 摘要 因特网[I蕴藏着 卜富的分了生物学信息资源，同时也提供大量实用的生物应用软件，它们在生物科 学研究和医学领域中起着不可估量的作用，研究人员应充分利用这些珍贵的知识财富和工具，不断探索与 追求，不断开发与创新，才能使科研达到更高的水平。本文综合地介绍了因特网上分子生物学信息资源的 开发与应用。 关键词 f}l}tk}l信息布资源 分子生物学 因特网是当今世界信息交流的一项重要工具和手段，提供了浩如烟海的信息资源。网 络的全球化构建了世界性的信息高速公路，对于研究分子生物学和医学的人来说，学习、 掌握、运用和开发这一庞大的信息资源是当务之急，这将方便、有利、推动研究和应用的 顺利进行。 因特网上的信息资源与纸载体的文献信息资源有完全不同的特点与优点:(1)信息量 大。因特网突破了时间和空间的局限，几乎囊括了不同时期世界各大学、研究所、国家图 书馆、大型数据库所有文献和资料。(2)方便查询。它具有功能强大的检索系统，输入关 键词或其他查询条件，用鼠标点击 Iogon或 submit即可获得所需的信息。(3)信息资源 不断充实与更新。其速度之快、频率之高是前所未有的。(4)功能强大、丰富多彩的多媒体。 这种新技术是传统的文字载体模式无法比拟的。(5)丰富的免费资源。研究人员可在因特网 上免费文献检索、基因库检索和生物学软件的应用。(6)方便快捷的下载和打印，所见即所 得。(7)容易掌握，便于自学。无论多么复杂和庞大的数据库或软件，在网站主页中都有内 容介绍、帮助系统和通往各分支的超链接。在当今知识爆炸的时代，充分利用这些资源， 及时得到所需的信息是十分有益而且必要的。 分子生物学是研究自然界有生命物质的分子结构与功能的科学，从30年代起科学家们 就开始探索基因之谜，展开对基因的本质、功能、结构以及遗传信息、蛋白质体系等一系 列课题进行深入的研究。分子生物学在因特网上的信息资源主要有以下内容。 1基因序列的查询 基因组是由四种不同的脱氧核糖核普酸 (A,T,C,G)按照特定的编码规律串联成的 脱氧核糖核酸链 (DNA)，其中蕴藏着生物体中所有的结构信息和控制信息，其功能单位可 转录为核糖核昔酸(RNA)，有些则被翻泽成各种蛋白质而行使生物体构建和生命调控功能， 基因组完整表达了生物体的构造和运转情况。进入基因库，查询大量有用的信息，便开启 第四届海峡两岸科技信息交流研讨会论文集 了生命科学更深层次的大门。 世界上三大基因库在因特网上向全球所有分子生物学研究人员免费开放。美国的 GenBank、欧洲的EMBL、 日本的DDBJ提供核首酸序列的查询。GenBank是美国国家 生物技术信息中心NCBI(NationalCenterforBiotechnologyInformation)于1982年创建的， GenBank有160多万条记录，含1053000000个碱基，并以每22个月增加一倍的速度增长。 在NCBI可免费获取核营酸序列、蛋自质序列、蛋白质三维结构、基因组结构和染色体图 谱等信息。进入主页的网址是 ,启动主页的Entrez，点击 Nuclieotides,输入检索词，即可浏览核营酸序列的内容，在GenBankReport格式下显示完 整的基因记录，包括基因位点、基因定义、基因存取号、核酸编号、关键词、来源、组织 分类、参考文献、著作者、标题、期刊名、序列特征等.而FASTA格式则显示G.A,T, C四种碱基列出的核昔酸序列。EMBL(EuropeanMolecularBioloogyLaborato叻建于 1974年，是世界上最早、最大的核酸序列数据库和蛋白质序列数据库，收集了200多万核 酸序列共23亿碱基对。由西欧14国和以色列维护，主试验室在德国的Heidelberg，其他分 部分别设在德国的Hamburg、法国的Grenoble、英国的 Hinxton(EBIEuropean BioinformaticsInstitute)和意大利的Monterotondo。EMBL是欧洲各国科学家进行分子生 物学的基础研究、高级人才培训、提供分子生物学实验设备的基地.这个欧洲著名的