大豆籽粒不同发育时期基因表达谱分析-北京玛格泰克科技发展有限公司.pdfVIP

２０１２年４月 中国油料作物学报 ２０１２，３４（２）：１２９－１３５ Ｃｈｉｎｅｓｅｊｏｕｒｎａｌｏｆｏｉｌｃｒｏｐｓｃｉｅｎｃｅｓ 大豆籽粒不同发育时期基因表达谱分析 １，２ １ ３ ２ ２ ２ ２ １ １，２ ２ 陈　欢 ，杨美英 ，王真慧 ，孙　 ，王　刚 ，魏　玮 ，关　瑜 ，王法微 ，李海燕 ，陈　光 （１．吉林农业大学生物反应器与药物开发教育部工程研究中心，吉林 长春，１３０１１８； ２．吉林农业大学生命科学学院，吉林 长春，１３０１１８； ３．东北师范大学分子表观遗传学教育部重点实验室，吉林 长春，１３００２４） 　　摘要：以花后１５ｄ的大豆籽粒作为对照，通过Ｓｏｌｅｘａ高通量测序方法对花后３５ｄ、５５ｄ和６５ｄ的大豆籽粒进行转 录水平上的检测，并结合ＧＯ功能注释和ｐａｔｈｗａｙ分析，共有差异表达ｕｎｉｇｅｎｅ为９９０５个，其中调控脂肪酸合成途径 的显著差异表达基因１２个，蛋氨酸代谢途径关键基因６个。以花后５５ｄ的ｃＤＮＡ为样本，荧光定量ＰＣＲ检测了１２个 差异表达基因，其结果可与测序结果互为印证。 关键词：大豆；油脂；蛋白质；脂肪酸；蛋氨酸；差异表达基因 中图分类号：Ｓ５６５．１０３　　文献标识码：Ａ　　文章编号：１００７－９０８４（２０１２）０２－０１２９－０７ Ｇｅｎｅｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｐｒｏｆｉｌｅｏｆｄｅｖｅｌｏｐｉｎｇｓｏｙｂｅａｎｓｅｅｄｓ １，２ １ ３ ２ ＣＨＥＮＨｕａｎ ，ＹＡＮＧＭｅｉ－ｙｉｎｇ，ＷＡＮＧＺｈｅｎ－ｈｕｉ，ＳＵＮＹａｎｇ， ２ ２ ２ １ １，２ ２ ＷＡＮＧＧａｎｇ，ＷＥＩＷｅｉ，ＧＵＡＮＹｕ，ＷＡＮＧＦａ－ｗｅｉ，ＬＩＨａｉ－ｙａｎ ，ＣＨＥＮＧｕａｎｇ （１．ＭｉｎｉｓｔｒｙｏｆＥｄｕｃａｔｉｏｎＥｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇＲｅｓｅａｒｃｈＣｅｎｔｅｒｏｆＢｉｏｒｅａｃｔｏｒａｎｄＰｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ，ＪｉｌｉｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｃｈａｎｇｃｈｕｎ１３０１１８，Ｃｈｉｎａ； ２．ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＬｉｆｅＳｃｉｅｎｃｅｓ，ＪｉｌｉｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｃｈａｎｇｃｈｕｎ１３０１１８，Ｃｈｉｎａ； ３．ＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＭｏｌｅｃｕｌａｒＥｐｉｇｅｎｅｔｉｃｓｏｆＭＯＥａｎｄＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＧｅｎｅｔｉｃｓ＆Ｃｙｔｏｌｏｇｙ， ＮｏｒｔｈｅａｓｔＮｏｒｍａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｃｈａｎｇｃｈｕｎ１３００２４，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｓｏｌｅｘａｈｉｇｈ－ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔＲＮＡ－ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇｗｅｒｅｐｅｒｆｏｒｍｅｄｏｎ３５ＤＡＦ（ｄａｙｓａｆｔｅｒｆｌｏｗｅｒｉｎｇ）， ５５ＤＡＦａｎｄ６５ＤＡＦｓａｍｐｌｅｓａｔｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎａｌｌｅｖｅｌ，ｗｈｉｌｅｓｅｅｄｓａｔ１５ＤＡＦｓｅｒｖｅｄａｓｃｏｎｔｒｏｌ．Ｔｏｔａｌｌｙ９９０５ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ ｅｘｐｒｅｓｓｅｄｕｎｉｇｅｎｅｓｗｅｒｅｃｏ－ｅｘｐｒｅｓｓｅｄｇｅｎｅｓ．ＣｏｍｂｉｎｅｄｗｉｔｈＧＯｆｕｎｃｔｉｏｎａｌａｎｎｏｔａｔｉｏｎａｎｄｐａｔｈｗａｙａｎａｌｙｓｉｓ，１２ｎｏ ｖｅｌｃｏ－ｅｘｐｒｅｓｓｅｄｕｎｉｇｅｎｅｓｔｈａｔｒｅｇｕｌａｔｅｄｆａｔｔｙａｃｉｄｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓｐａｔｈｗａｙａｎｄ６ｎｏｖｅｌｃｏ－ｅｘｐｒｅｓｓｅｄｕｎｉｇｅｎｅｓｔｈａｔ ｒｅｇｕｌａｔｅｄｍｅｔｈｉｏｎｉｎｅｍｅｔａｂｏｌｉｓｍｗｅｒｅｆｏｕｎｄ．ｑ