分子生物学3 PPT.ppt

3 生物信息的传递（上）;DNA;3.1 RNA转录的基本过程;3.1.1 模板识别;3.1.2 转录起始;3.1.4 转录终止;2. 强终止子（不依赖蛋白因子）;3.2 转录机器的主要成分;3.2.1 RNA聚合酶;1. 原核生物RNA聚合酶;σ能提高RNA聚合酶与特异启动子的亲和力，也能降低与非特异启动子的亲和力。 新生RNA链达到6-9个核苷酸，形成稳定的酶-DNA-RNA复合物时，σ因子释放。;Sigma factors in E. coli: σ70 (RpoD) - the housekeeping sigma factor or also called as primary sigma factor, transcribes most genes in growing cells. Makes the proteins necessary to keep the cell alive. σ54 (RpoN) - the nitrogen-limitation sigma factor σ38 (RpoS) - the starvation/stationary phase sigma factor σ32 (RpoH) - the heat shock sigma factor, it is turned on when exposed to heat σ28 (RpoF) - the flagellar sigma factor σ24 (RpoE) - the extracytoplasmic/extreme heat stress sigma factor σ19 (FecI) - the ferric citrate sigma factor, regulates the fec gene for iron transport There are also anti-sigma factors that inhibit the function of sigma factors and anti-anti-sigma factors that restore sigma factor function.;RNA聚合酶横跨40bp;;;RNA polymerase II 的结构;3.2.2 转录复合物;转录循环理论：;结合顺序：D-A-B-F-E-H;3.3 启动子与转录起始;3.3.1 启动子区的基本结构;R:嘌呤 Y:嘧啶;E. coli promoters;原核启动子的共有序列和共有间距;3.3.2 启动子区的识别;;;3.3.3 RNA聚合酶与启动子区的结合;RNA polymerase passes through several steps prior to elongation;扩展：;3.3.4 -10区与-35区的最佳距离;3.3.5 增强子(enhancer)及其功能;绝缘子（insulator）是真核生物基因组的调控元件之一，亦为一种边界元件。功能为阻止临近调控元件，对它所界定基因的启动子其增强或者阻遏的作用。它对增强子的抑制作用具有极性，即只对处于其所在边界另一侧的增强子有抑制作用，而并不能抑制与其处于同一结构域的增强子。;3.3.6 真核生物启动子对转录的影响;转录调控因子;3.3.7 转录的抑制;3.4 原核与真核生物mRNA的特征比较;3.4.1 原核生物mRNA的特征;2 许多原核生物mRNA可能以多顺反子的形式存在;50SrRNA;噬菌体：;3 原核生物mRNA的5‘端无帽子结构，3’端没有或只有较短的polyA结构;;例子;原核生物mRNA很少经过加工，但在少数情况下多顺反子mRNA被核酸内切酶剪切成小片段，再作为翻译的模板。;3.4.2 真核生物mRNA的特征;1 真核生物mRNA的5‘端存在“帽子”结构;;0类帽子（cap0） 1类帽子（cap1） 2类帽子（cap2）占有帽mRNA总量10-15%以下。;帽子结构可使mRNA免遭核酸酶的破坏，而且有帽子结构的mRNA更容易被蛋白质合成的起始因子所识别，从而促进蛋白质的合成（实验发现mRNA5’端甲基化帽子是翻译所必需的，且有可能是蛋白质合成起始信号的一部分）。 The 5 cap has 4 main functions:Regulation of nuclear export.Prevention of degradation by exonucleases.Promotion of translation (see ribosome and translation).Promotion of 5 proximal intron excision. ——/wiki/5_cap ;2 绝大多数真核生物