利用神经网络和一致结构序列预测蛋白质二级结构研究.pdfVIP

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2018-01-18 发布于未知
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利用神经网络和一致结构序列预测蛋白质二级结构研究.pdf

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计算机研究与发展 ISSN1000—1239／CN11-1777／TP of Researchand JournalComputer Development 42(增刊)：320～324，2005 利用神经网络和一致结构序列预测蛋白质二级结构李小妹王能超 (华中科技大学计算机科学与技术学院武汉430074) (1xmdwj@163．corn) Protein StructurePredictioninNeuralNetworkConsensus Secondary Using Structure Sequences LiXiaomeiand WangNengchao Scienceand Scienceand (CollegeofComputer Technology，HuazhongUniversityof Technology，Wuhan430074) The of441different Abstracttotal whicheach has common on sequencegroups，of grouplong substring the among areselectedfromPDB．Thenetworkthe common primarysequence proteins usinglongest andconsensusstructure are to the structure substring sequencedesignedpredictproteinsecondary including is helix，strandandcoil．Thisinformationusedto the structure improveproteinsecondary prediction and flbetter thanthe nine—foldcross—validationona accuracyget performancepreviousmethods．Using databaseof441 a fromeach methodanoverall proteinsselectingrepresentativeprotein group，thisgives of72．68％with Matthow’Scorrelationcoefficients0．62．0．55and predictionaccuracy corresponding the resultshowsthatthenetworkonnon—consensusstructure canobtain 0．54；Butexperiment sequences of71．03％with Matthow’Scorrelationcoefficients0．60．0．54and0．52 accuracy corresponding prediction thesamenetworkstructureandsame using parameters． wordsneural structure