遗传作图 物理图.ppt

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遗传作图 物理图

基本概念;基因组学; 什么是基因组?; 基因组研究内容;基因组学的分类;基本概念;基本概念;;基本概念;基本概念;基本概念;基本概念;基因组计划; 基因组计划 ? 获得全基因组序列:为基因组的全面测序提供工作框架 构建基因组图:在长链DNA分子上寻找特征性标记,根据分子标记将包括这些序列的克隆进行连锁定位,绘制基因组图。 根据基因组图,基因组区段分解、逐个测序,最后进行组装 ;;; 基因组作图的方法;基因组学(genomes);第二章 遗传作图;2.1 基因组作图的方法;2.1 基因组作图的方法;2.2遗传作图中使用的标记;2.2.1 基因标记;2.2.1 基因标记;;2.2.2 DNA(分子)标记;2.2.2 DNA(分子)标记;2.2.3 遗传作图中标记的发展;2.2.3 遗传标记中的第一代标记;2.2.3 遗传标记中的第一代标记;;2.2.3遗传标记中的第二代标记;;2.2.3遗传标记中的第三代标记;;2.3 遗传作图的方法;;部分连锁与遗传作图;连锁遗传图的做法;不同模式生物的连锁分析;杂交实验的连锁分析;系谱分析;细菌的遗传作图;细菌的遗传重组;;RFLP连锁图;DNA限制酶分析;;RFLP连锁图;基因与分子标记的共分离;简单序列长度多态性;;2.4 人类遗传图;第三章 物理作图;;3.1 限制性作图;;;;3.2 基于克隆的基因组作图;;;;;;质粒*;3.2.2 重叠群组建;;指纹作图 指纹fingerprinting:DNA样品所具有的特定DNA片段组成,限定的序列特征。指纹重叠,表明2个克隆具有共同的区段 限制性带型指纹:用不同限制性酶处理样品,凝胶分析,DNA条带有部分相同,说明它们含有重叠的序列 重复序列DNA指纹:不同克隆酶解电泳,转移到杂交膜中,用一种或几种基因组范围的重复序列作为探针杂交,出现相同的杂交带型,说明重叠 重复序列DNA PCR:设计与重复序列互补的引物,对检测的克隆进行PCR扩增,相同的产物,说明重叠 STS目录作图:STS是已知的单一序列。设计引物,对大量的单个克隆进行PCR扩增;;3.3 荧光标记原位杂交;3.4 序列标记位点(STS)作图;;;STS定位:定位在染色体或基因组中的DNA区段 辐射杂种:含有另一种生物染色体片段的啮齿类细胞 克隆作图:基因组测序计划的准备工作之一,将基因组或分离的染色体打断,并将这???片段克隆到高容量的载体中,构建全基因组文库。 PCR方法检测含有标记的STS克隆,根据重叠的STS标记可绘制克隆连锁图;;人类基因组物理图;SNP作图的一般步骤包括:;鸟枪法和重叠群法;什么是鸟枪法;重叠群法;重叠群法;基因组测序的不同策略;;基因组测序的不同策略

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