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桦剥管菌srap分子标记反应体系优化与遗传多样性分析

第38 卷 第1 期 中南林业科技大学学报 Vol. 38 No. 1 2018 年 1 月 Journal of Central South University of Forestry Technology Jan. 2018 Doi:10.14067/ki.1673-923x.2018.01.006 http: // 桦剥管菌SRAP分子标记反应体系优化与 遗传多样性分析 彭 木,王秋玉,闫绍鹏 (东北林业大学 生命科学学院,黑龙江 哈尔滨 150040 ) 摘 要:桦剥管菌 Piptoporus betulinus 作为一种褐腐真菌,是白桦木材的专性腐朽菌,在工业污染物降解和 医药领域中起着重要作用。以桦剥管菌为材料,在 SRAP-PCR 体系优化的基础上,对来自东北主要林区(带 岭、塔河、帽儿山以及敦化)不同种群的桦剥管菌进行遗传多样性分析,为桦剥管菌多态性鉴定以及进一步 利用提供理论依据。结果表明:用单因素法及均匀设计法优化后的 SRAP-PCR 体系为 10×Buffer 2.0 μL 、 2+ Primer 各 8 μmol/L 、dNTP 16 mmol/L 、Taq polymerase 2.5 U 、DNA 12 ng 、Mg 45 mmol/L ,总体积 20 μL ; 利用优化的反应体系筛选出 15 对引物,并扩增出 239 条清晰的条带,其中 237 条为多态性条带,多态性比率 为 99.16% ;采用POPGENE 软件分析,4 个种群的平均有效等位基因平均数、平均 Nei ’s 多样性指数、平均 Shannon 多样性指数分别为 1.499 5、0.303 0、0.465 5 ;系统聚类结果显示,15 个菌株分成了两个类群,这一结 果表明来自同一地点菌株的遗传背景较为相似,揭示了桦剥管菌菌株间遗传特性与地理分布间的相互关系。 关键词:桦剥管菌;SRAP;反应体系优化;遗传多样性 中图分类号:S718.43 文献标志码:A 文章编号:1673-923X(2018)01-0029-08 Optimization of SRAP reaction system and genetic diversity analysis of Piptoporus betulinus from different populations PENG Mu, WANG Qiuyu, YAN Shaopeng (College of Life Sciences, Northeast Forestry University, Harbin 150040, Heilongjiang, China) Abstract: Piptoporus betulinus, as a kind of brown rot fungus specially decaying the birch wood, plays a vital role in degradation of P. betulinus ’ industrial pollut

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