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第3讲 基因的转录表达与调控1
启动子是DNA分子可以与RNA聚合酶特异结合的部位,也就是使转录开始的部位。在基因表达的调控中,转录的起始是个关键。常常某个基因是否应当表达决定于在特定的启动子的起始过程。 DNA链上从启动子直到终止子为止的长度称为一个转录单位。一个转录单位可以包括一个基因(真核),也可以包括几个基因(原核)。 3.4.2 原核生物转录的起始延伸 启动子(promoter)的结构和转录起始 (1)结构典型,都含识别(R),结合(B)和起始(I) 位点; (2)序列保守; (3)位置和距离都比较恒定; (4)直接和多聚酶相结合; (5)常和操纵子相邻; (6)位于基因的5′端; (7)决定转录的启动和方向。 (8)特殊的操纵子的R,B序列不同。 E.coli中不同的?因子 可识别不同的启动子 Flash 演示 transcription 5-9bp 16——19bp Pribnow box -35 hexamer 比较不同原核生物的启动子序列 1). -10序列: -10序列是由Pribnow和Schaller(1975)发现,故也称为Pribnow框盒(Pribnow box)。 保守序列为T80A95T45A60A50T9 位于-10bp左右,A.T较丰富,易于解链。其功能是: (1) RNA pol紧密结合; (2) 形成开放启动复合体; (3) 使RNA pol定向转录。 -10序列对转录的效率影响 TATAAT→AATAAT,转录效率下降,称为下降突变(down mutation)。 TATGTT→TATATT,转录效率上升,为上升突变(up mutation)。 以上突变为何会影响转录效率? 前者可能由于T-A的堆集能要小于A-T的堆积能,后者可能是由于堆集能降低和氢键的减少, 2). -35序列 -35序列又称为Sextama盒(Sextama box), 其保守序列为(T82T84G78A65C54A45) 其功能是: (1) 为RNA pol的识别位点。 σ亚基识别-35序列,为转录选择模板 (2)-35和-10序列的距离是稳定的,此与RNA pol的结构有关。 生物信息学分析 利用复制起始结构的特点,开发生物信息学分析软件,寻找和分析DNA序列 中的复制起始位点,并设计相关实验验证. 线粒体导肽的验证 iPSORT WWW Service The underlined sequences correspond to mitochondrial transit signals predicted with predicted with probabilities of 0.95 and 0.97,respectively. (Wang, Z., Zou, Y., 2006)Cytoplasmic male sterility of rice with boro II cytoplasm is caused by a cytotoxic peptide and is restored by two related PPR motif genes via distinct modes of mRNA silencing. Plant Cell. 18, 676-87.) GFP sequence NOS 35S prom-oter Transit peptide Sequence (RF1A,RF1B ) 转基因载体的构建 GFP荧光蛋白 绿光和红光能够重合,发出黄光, 证明RF1A和RF1B确实是线粒体导肽序列 (Wang, Z., Zou, Y., 2006, Plant Cell. 18, 676-87.) 3). 转录起始位点(I)。 转录开始时模板上的第一个碱基 在原核中常为A或G 而且位置固定 第三章 生物信息学的传递-从DNA到RNA(1) 南昌大学生科院 彭晓珏 中心法则的提出(1970 Crick) 基本概念 转录机器的主要成分 转录的基本过程(E.coli) 内容提要: mRNA的发现 1955年Brachet用洋葱根尖和变形虫进行试验 若加入RNA酶,则蛋白质合成就停止 如果加入从酵母中提取的RNA,又可以合成蛋白质 同年,Goldstein 和Plaut用同位素标记RNA前体 发现标记的RNA在核内 标记追踪实验:经过一段时间发现,被标记的RNA在细胞质中间 Jacob和Monod预言: (1)这种“ 信使”应是一个多核苷酸; (2)其分子平均不小于5?105bp,足以携 带一个基因的
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