第一章生物信息学的生物学基础__....ppt

遗传密码的破译 Brenner 和Crick提出遗传密码是3个核苷酸组成的。组成蛋白质的氨基酸由20种，两联体42=16太少， 三联体43=64正好，四联体4４=256太多 1961年起Nirenberg用人工mRNA体外蛋白质合成法（ployU合成只含Phe的多肽） 、氨酰tRNA结合法（笨丙氨酰tRNA只与polyU核糖体复合物聚合）以及Khorana用重复共聚物模板法（CUCUCUCU获得亮氨酸丝氨酸交替多肽）证明了所有遗传密码 Nirenberg和Khorana获得1968年诺贝尔奖 五、基因与基因组 第一个核苷酸 （5’端） 第二个核苷酸 第三个核苷酸 （3’端） U C A G U UUU 苯丙 UUC 苯丙 UUA 亮 UUG 亮 UCU 丝 UCC 丝 UCA 丝 UCG 丝 UAU 酪 UAC 酪 UAA 终止 UAG 终止 UGU 半胱 UGC 半胱 UGA 终止 UGG 色 U C A G C CUU 亮 CUC 亮 CUA 亮 CUG 亮 CCU 脯 CCC 脯 CCA 脯 CCG 脯 CAU 组 CAC 组 CAA 谷酰 CAG 谷酰 CGU 精 CGC 精 CGA 精 CGG 精 U C A G A AUU 异亮 AUC 异亮 AUA 异亮 AUG 甲硫 ACU 苏 ACC 苏 ACA 苏 ACG 苏 AAU 天酰 AAC 天酰 AAA 赖 AAG 赖 AGU 丝 AGC 丝 AGA 精 AGG 精 U C A G G GUU 缬 GUC 缬 GUA 缬 GUG 缬 GCU 丙 GCC 丙 GCA 丙 GCG 丙 GAU 天冬 GAC 天冬 GAA 谷 GAG 谷 GGU 甘 GGC 甘 GGA 甘 GGG 甘 U C A G 遗传密码表 五、基因与基因组 符 号 含 义 说 明 G G Guanine A A Adenine T T Thymine C C Cytosine R G or A Purine Y T or C Pyrimidine M A or C Amino K G or T Keto S G or C Strong interaction (3 H bonds) W A or T Weak interaction (2 H bonds) H A or C or T Not-G B G or T or C not-A V G or C or A not-T(not-U) D G or A or T not-C N G or A or T or C Any 扩展遗传字母表 五、基因与基因组 遗传密码的基本特性 密码的连续性：无标点符号 起始密码子 AUG(G U C)；终止密码子：UAA(UAG,UGA) 密码的简并性（degeneracy）： 即多数氨基酸由多个密码子编码 密码的通用性：所有生物通用 密码的特殊性：个别生物以及线粒体有特殊密码子 五、基因与基因组 64 codons?20 amino acids：同一个氨基酸有1个或1个以上密码子 3种氨基酸?6 codons (Leu, Ser, Arg) 5种氨基酸?4 codons (Val, Pro, Ala, Gly, Thr) 1种氨基酸?3 codons (Ile, STOP) 9种氨基酸?2 codons (Phe, Tyr, His, Gln, Asn, Lys, Asp, Glu, Cys) 2种氨基酸?1 codons (Met, Trp) 同义密码子(synonymous codon)：对应于同一氨基酸的密码子 遗传密码的简并性 五、基因与基因组 普遍性：对大多数病毒、原核生物、真菌、植物、动物都适用； 特殊性： 支原体：UGA ?色氨酸(Trp) 嗜热四膜虫：UAA ?谷氨酰胺(Gln) 线粒体：与核DNA编码的氨基酸有部分差异 线粒体DNA与核DNA密码差异 物种 密码 线粒体DNA编码的氨基酸 核DNA编码的氨基酸 所有 UGA Trp STOP 酵母 CUA Thr Leu 果蝇 AGA Ser Arg 哺乳类 AGA/AGG STOP Arg AUA Met Ile 遗传密码的普遍性与特殊性 五、基因与基因组 染色体(chromosome) 短臂 着丝粒 长臂 DNA 染色单体 遗传物质载体 组成：DNA和蛋白质 特征： 分子结构相对稳定； 能够自我复制； 能够指导蛋白质合成； 能够产生可遗传的变异。 五、基因与基因组 真核细胞染色体上的蛋白质主要包括组蛋白和非组蛋白。 组蛋白是一类较小而带有正电荷的核蛋白，与DNA有很高的亲和力。组蛋白是染色体的结构蛋白，它与DNA组成核