草菇谷胱甘肽过氧化物酶编码基因 vv-gpx01的序列特征及表达分析 Sequence Characteristics and Expression Analysis of a Glutathione Peroxidase Gene vv-gpx01 from Volvariella volvacea.pdfVIP

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2018-01-30 发布于上海
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草菇谷胱甘肽过氧化物酶编码基因 vv-gpx01的序列特征及表达分析 Sequence Characteristics and Expression Analysis of a Glutathione Peroxidase Gene vv-gpx01 from Volvariella volvacea.pdf

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草菇谷胱甘肽过氧化物酶编码基因 vv-gpx01的序列特征及表达分析 Sequence Characteristics and Expression Analysis of a Glutathione Peroxidase Gene vv-gpx01 from Volvariella volvacea

吉林农业大学学报　２０１４，３６（５）：５４０～５４５ｈｔｔｐ：／／ｘｕｅｂａｏ．ｊｌａｕ．ｅｄｕ．ｃｎＪｏｕｒｎａｌｏｆＪｉｌｉｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙＥ⁃ｍａｉｌ：ｊｌｎｄｘｂ＠ｖｉｐ．ｓｉｎａ．ｃｏｍ草菇谷胱甘肽过氧化物酶编码基因ｖｖ⁃ｇｐｘ０１的序列特征及表达分析∗ 严俊杰，郭丽石羡，赵静静，谢宝贵∗∗ 福建农林大学菌物研究中心，福州３５０００２摘　要：依托草菇基因组及转录组数据，克隆得到１个谷胱甘肽过氧化物酶（ＧＰｘ）编码基因，命名为ｖｖ⁃ ｇｐｘ０１。ＺＯＯＭ软件的分析结果表明：该基因全长１３１３ｂｐ，含有４个外显子、３个内含子，编码２２８个氨基酸；５′端非翻译区长为１２ｂｐ，３′端非翻译区为４５２ｂｐ；其中３个内含子在ＲＮＡ加工过程中均存在保留现象。生物信息学分析结果表明：草菇的ＧＰｘ０１序列具备完整的谷胱甘肽过氧化物酶保守结构域；系统发育树显示，担子菌与子囊菌的ＧＰｘ分别聚在了２个不同的分支上，草菇ＧＰｘ０１与双孢蘑菇亲缘关系较近并与其他伞菌目的真菌聚在１个分支上。另外，由内含子保留所产生的氨基酸序列均出现了不同程度的功能域缺失，这将导致谷胱甘肽过氧化物酶的失活。表达谱分析结果表明：ｖｖ⁃ｇｐｘ０１在整个草菇生长阶段都有表达，但表达量存在差异。推测，草菇ＧＰｘ０１可能通过可变剪接产生不同的转录本，通过调节不同转录本的表达水平来调控基因功能域的翻译水平及空间构型，最终实现酶活性的调节。关键词：草菇；谷胱甘肽过氧化物酶；可变剪接；基因结构；系统进化；差异表达中图分类号：Ｓ６４６１３；Ｑ７８６　　　文献标识码：Ａ　　　文章编号：１０００⁃５６８４（２０１４）０５⁃０５４０⁃０６ＤＯＩ：１０．１３３２７／ｊ．ｊｊｌａｕ．２０１４．１９６８引文格式：严俊杰，郭丽石羡，赵静静，等．草菇谷胱甘肽过氧化物酶编码基因ｖｖ⁃ｇｐｘ０１的序列特征及表达分析［Ｊ］．吉林农业大学学报，２０１４，３６（５）：５４０⁃５４５．ＳｅｑｕｅｎｃｅＣｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓａｎｄＥｘｐｒｅｓｓｉｏｎＡｎａｌｙｓｉｓｏｆａＧｌｕｔａｔｈｉｏｎｅＰｅｒｏｘｉｄａｓｅＧｅｎｅｖｖ⁃ｇｐｘ０１ｆｒｏｍＶｏｌｖａｒｉｅｌｌａｖｏｌｖａｃｅａＹＡＮＪｕｎ⁃ｊｉｅ，ＧＵＯＬｉ⁃ｘｉａｎ，ＺＨＡＯＪｉｎｇ⁃ｊｉｎｇ，ＸＩＥＢａｏ⁃ｇｕｉＭｙｃｏｌｏｇｉｃａｌＲｅｓｅａｒｃｈＣｅｎｔｅｒｏｆＦｕｊｉａｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌａｎｄＦｏｒｅｓｔｒｙＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｆｕｚｈｏｕ３５０００２，ＣｈｉｎａＡｂｓｔｒａｃｔ：ＢａｓｅｄｏｎｇｅｎｏｍｅａｎｄｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅｄａｔａｏｆＶｏｌｖａｒｉｅｌｌａｖｏｌｖａｃｅａ，ａｇｅｎｅｅｎｃｏｄｉｎｇｇｌｕｔａ⁃ ｔｈｉｏｎｅｐｅｒｏｘｉｄａｓｅ（ＧＰｘ）ｗａｓｃｌｏｎｅｄ，ａｎｄｎａｍｅｄａｓｖｖ⁃ｇｐｘ０１．ＴｈｅｒｅｓｕｌｔｓａｎａｌｙｚｅｄｂｙＺＯＯＭｓｏｆｔ⁃ ｗａｒｅｓｈｏｗｅｄｔｈａｔｖｖ⁃ｇｐｘ０１ｃｏｎｔａｉｎｅｄ１３１３ｂｐ，ｅｎｃｏｄｉｎｇａｐｏｌｙｐｅｐｔｉｄｅｏｆ２２８ａｍｉｎｏａｃｉｄｓ．ｖｖ⁃ ｇｐｘ０１ｇｅｎｅｃｏｎｔａｉｎｅｄ４ｅｘｏｎｓａｎｄ３ｉｎｔｒｏｎｓ，５′ＵＴＲｃｏｎｔａｉｎｅｄ１２ｂｐ，３′ＵＴＲｃｏｎｔａｉｎｅｄ４５２ｂｐ．ＡｎｄｔｈｒｅｅｉｎｔｒｏｎｒｅｔｅｎｔｉｏｎａｌｔｅｒｎａｔｉｖｅｓｐｌｉｃｉｎｇｓｉｔｅｓｗｅｒｅｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄｄｕｒｉｎｇＲＮＡｐｒｏｃｅｓｓｉｎｇ．ＴｈｅｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓａｎａｌｙｓｉｓｓｈｏｗｅｄＧＰｘ０１ｏｆＶｏｌｖａｒｉｅｌｌａｖｏｌｖａｃｅａｈａｄａｃｏｍｐｌｅｔｅｃｏｎｓｅｒｖｅｄｄｏｍａｉｎｏｆｇｌｕｔａｔｈｉｏｎｅｐｅｒｏｘｉｄａｓｅ．Ｔｈｅａｎａｌｙｓｉｓｏｆｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃｔｒｅｅｓｈｏｗｅｄｔｈａｔｇｌｕｔａｔｈｉｏｎｅｐｅｒｏｘｉｄａｓｅｏｆ