计算系统生物学导论.ppt

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什么是癌症 What is cancer ? 亦称恶性肿瘤(malignant tumor) 癌症(cancer):因控制细胞生长增殖机制失常而引起的疾病。癌细胞除了生长失控外,还会局部侵入周遭正常组织甚至经由体内循环系统或淋巴系统转移到身体其他部分。 癌症:全球的健康问题 癌症是全世界一个主要死亡原因。每年导致癌症总死亡率的主要癌症种类为: 肺癌(130万死亡) 胃癌(80.3万死亡) 结肠癌(63.9万死亡) 肝癌(61万死亡) 乳癌(51.9万死亡) 中国癌症死亡 尽管人们都接触各种致癌因子,并不一定都发生癌症,这表明,癌症的发生是环境因素和遗传因素共同决定的。 ? 引用一个哲学观点,“外因是变化的条件,内因是变化的根椐,外因通过内因而起作用”。 环境因素只有改变遗传物质(DNA/RNA)的结构或功能才能使正常细胞转变为癌细胞。 对于不同的个体/不同的癌症,环境因素与遗传因素对其作用的大小各异。 癌发生的多阶段模式学说 结肠癌发生演进分子模型   突变 突变 突变 APC  DNA  K-ras DCC p53 转移 LOH 甲基化 突变  LOH   LOH  相关基因 (5q) (12p) (18q) (17p) 结肠腺 早期腺瘤 中期腺瘤  晚期腺瘤  结肠癌  转移 上皮增生 1cm 1cm无灶 1cm有灶 结肠癌发生的分子事件 癌基因 原癌基因proto-oncogene:调控细胞生长和增殖的正常细胞基因。突变后转化成为致癌的癌基因。 (accelerator in an automobile) 抑癌基因tumor suppressor gens: 调控细胞生长抑制肿瘤表型表达的基因。可通过纯合缺失或失活而引起细胞恶性转化。 ( brake in an automobile) 稳定性基因stability genes:DNA修复基因 (mechanics for an automobile ) 理解: 细胞癌基因是细胞正常生长、分化所必需的,是生长发育过程中所不可缺少的。 在发育过程中的一定时间、一定组织中定量的表达,产生生命活动中所必需的蛋白质,促进某些生命过程的进行,使生长发育得以实现。在机体生长发育过程完成后多处于关闭状态,即不表达或低表达。 一旦在错误的时间,不恰当地点,不适量表达即可能导致细胞无限制的增长而趋于恶性转化。 原癌基因(proto-oncogene) 正常细胞内存在的、 参与细胞生长分化并具有使细胞癌变潜能的基因 使细胞发生癌变、引起细胞无限增殖和恶性转化的基因。 在肿瘤细胞中原癌基因往往被激活,处于活跃表达的状态 癌基因数据库 cancer genes http://www.sanger.ac.uk/genetics/CGP/Census/ 目前收录457个癌基因 基因与癌症有什么关系? ?癌症是基因失控造成的疾病,控制细胞有序再生更新的基因受到损伤,使细胞不受控制的生长,并且侵入邻近的组织,还向全身转移。所有癌症都与基因有关,由 不正常的基因引起。然而只有一小部份癌症有遗传因素,也就是与癌症相关的基因通过父母传给后代所有的体细胞。大多数癌症是因为环境因素造成基因的改变。 探查基因组的异常改变 基因组异常改变类型 突变 mutation 拷贝数改变 copy number alteration 甲基化异常 changes of DNA methylation 突变 mutation 基因突变是指基因在结构上发生碱基对组成或排列顺序的改变。 突变是指由于核酸序列发生变化,包括缺失突变、定点突变、移框突变等,使之不再是原有基因的现象。 突变可分体细胞突变和生殖细胞突变两大类 基因拷贝数改变 Copy number alteration gene amplification扩增: 为一特异蛋白质编码的基因的拷贝数选择性地增加而其他基因并未按比例增加的过程。 gene deletion缺失:一种特殊的突变:缺少染色体上的一段DNA片段。基因缺失或部分基因缺失将导致疾病或畸形。 基因拷贝数改变 Copy number alteration DNA甲基化 (DNA methylation ) 在DNA上添加甲基基团的一种化学修饰作用。DNA甲基化状态的改变可导致基因结构和功能异常。 CpG岛的异

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