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DB12_T649-2016甜瓜品种纯度SSR分子标记检测方法.pdf
ICS 67.050
B 31 DB12
天 津 市 地 方 标 准
DB 12/T 649—2016
甜瓜品种纯度SSR 分子标记检测方法
Methods of identifying varietal purity of muskmelon by using SSR-based markers
2016-09-27 发布 2016-11-01 实施
天津市市场和质量监督管理委员会发布
DB 12/T 649—2016
前 言
本标准按照GB/T 1.1—2009 给出的规则起草。
本标准由天津市农村工作委员会提出。
本标准起草单位:天津市农业质量标准与检测技术研究所、天津市蔬菜研究中心。
本标准主要起草人:兰青阔、张若纬、赵新、彭冬秀、王成、武云鹏、李秀秀、刘娜、徐石勇。
本标准2016 年9 月首次发布。
I
DB 12/T 649—2016
甜瓜品种纯度SSR 分子标记检测方法
1 范围
本标准规定了甜瓜品种纯度SSR分子标记检测方法的术语和定义、检测方法、纯度计算方法。
本标准适用于甜瓜单交种的纯度检测。
2 规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本
文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T 3543.2 农作物种子检验规程 扦样
GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法
3 术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1
品种纯度 Varieties Purity
品种纯度指种子在SSR分子标记带型方面典型一致的程度,用具有本品种特异带型的种子粒数占
检测样品种子粒数的百分率表示,以反映某品种特征特性的一致性程度。
3.2
聚合酶链式反应 PCR (Polymerase Chain Reaction )
一种在体外通过酶促反应扩增特异DNA片段的技术。
3.3
简单重复序列 SSR (Simple Sequence Repeat)
由几个核苷酸(1-6个)为重复单位聚集而成的长达几十个至几百个bp (一般为100-200bp )的串
联重复序列,又称微卫星序列或短串联重复序列,其高度多态性主要来源于串联数目的不同。
3.4
分子标记 Molecular Marker
以蛋白质、核酸分子的多态性为基础,检测生物在遗传上的差异。
4 原理
SSR分布于甜瓜整个基因组,每个位点上重复单位的数目不同造成了品种间的多态性,利用PCR
技术将多态的SSR扩增出来,通过电泳检测扩增产物,利用电泳图谱进行甜瓜品种纯度检测。
1
DB 12/T 649—2016
5 仪器设备及试剂
5.1 仪器设备
PCR仪;测序电泳槽;水平电泳槽;高压电泳仪(3000 V ,400 mA ,400 W );万分之一电子天
平;微量加样器;磁力搅拌器;台式离心机;紫外-可见成像系统;胶片观察灯;水平摇床;高压灭菌
锅;pH计等。
5.2 试剂
乙二胺四乙酸二钠(EDTA-Na );三羟甲基氨基甲烷(Tris );盐酸(HC
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