西伯利亚鲟Sox17基因cDNA全长的克隆及其表达分析.docVIP

西伯利亚鲟Soxl7基因cDNA全长的克隆 及其表达分析 宋炜陈芬芳张凤英马春艳赵明马凌波 中国水产科学研宄院东海水产研宄所农业部东海与 远洋渔业资源开发利用重点实验室上海海洋大学水 产与生命学院 采用RACE技术获得西伯利亚鲟(Acipenser baerii) Sox 17基因cDNA全长，序 列分析表明，西伯利亚鲟Soxl7基因cDNA全长2 671 bp,包括588 bp的5’端 非翻译区，901 bp的3’端非翻译区和编码393个氨基酸残基的1 183 bp开放阅 读框。氨基酸序列比对显示，该基因具较高的保守性，与塞内加尔多鳍鱼 (Polypterus senegalus)的相似度最高为72%。系统进化分析表明，丙伯利亚 鲜与塞内加尔多鳍鱼聚为一支，且支持率为95%。以延伸因子efla (elongation factor 1-alpha)作为内参基因，对Soxl7基因在西伯利亚鲭各组织的相对表达 量进行分析，发现Soxl7基因在不同组织中均有表达，但表达具有明显的组织 差异性。在脑中表达量最高，而在肾、血液、眼、肠和胸鳍5个组织中表达量均 较低。同时，Soxl7基因在丙伯利亚鲟不同发育时期均有表达，但表达具有一定 的吋间差异性。在宽神经板期的表达量高，相当于表达量最低点11日龄仔鱼的 167倍。本研究为量化西伯利亚鲟胚胎发育分化过程屮相关基因提供了参照工具, 同时可为今后深入研宂西伯利亚鲟Soxl7在胚胎发育过程中的作用提供基础参 考资料。 关键词： 西伯利亚色寻;Soxl7; cDNA全长;表达分析; 宋炜(1983-)，男，副研宄员，主要从事鱼类发育生物学研究。 E-mail:swift83@sina. com 马凌波，研究员。E-mail:malingbo@vip. sina. com 2017-05-22 基金：国家自然科学基金项0 Cloning, analysis and expression detection of full-length c DNA of Soxl7 from Acipenser baerii SONG Wei CHEN Fen-fang ZHANG Feng-ying MA Chun-yan ZHAO Ming MA Ling-bo Key Laboratory of East China Sea and Oceanic Fishery Resources Exploitation, Ministry of Agriculture， East China Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences; Abstract： In this study，the full-length cDNA of Soxl7 gene from Siberian sturgeon (Acipcnse baerii) was obtained using RACE techniques. The full-length of Sox 17 gene cDNA was 2 671 bp in length, including a 1183 bp open reading frame (ORF) encoded 393 amino acids, a 588 bp 5 untranslated region (5’ UTR) and a901 bp 3 untranslated region (3’UTR) . Multiple alignment analyses showed Siberian sturgeon was highly conservative to other fishes.It had high similarity with Ploypterus senegalus of 72% support rating. Phylogenetic analysis showd that Siberian sturgeon first clustered together with Ploypterus senegalus with the approval rating of 95%. And then efla (elongation factor 1 -alpha，efla) gene was used as a internal reference on detecting the expression of Soxl7 gene in various tissues of Siberian sturgeon by real-time fluorescence quan