基于RNA-seq技术的玉米CMS-C花药可变剪接和新转录本的研究-开题报告完成版演示幻灯片.pptVIP

基于RNA-seq技术的玉米CMS-C花药可变剪接和新转录本的研究;内容;1 文献综述;1.1 植物雄性不育;; 基因表达调控是植物发生雄性不育的重要影响因素。 Twell D等利用cDNA差别显示等分子生物学方法，己鉴定出花粉或花药特异基因。 曹家树等用mRNA差别显示技术。 Erickon等限制性内切酶酶切方法分析pol胞质和cam胞质的mtDNA，杂种后代分析。 袁美等利用Northen对波里马细胞质雄性不育三系线粒体RNA检测，发现3个探针atp6、orf224和orf222。 Leving S对玉米、Kadowaki对水稻的cpDNA酶切后电泳未发现不育系与保持系之间存在多态性。;1. 3 高通量测序（RNA-Seq ）技术;1. 4 可变剪接;1.4.1 可变剪接类型;在生物体内，主要存在7种可变剪接类型： A）Exon skipping; B）Intron retention; C) Alterna tive 5 splice site; D) Alternative 3 splice site; E) Alternative first exon; F) Alternative last exon; G) Mutually exclusive exon. ;1.4.2 中心法则与可??剪接;图 1-4 前体 mRNA 的构成性剪接和可变剪接事件;芯片技术：剪接连接点芯片技术和外显子芯片技术 寡核苷酸探针固定在玻璃片，每组探针都和特定的外显子或剪接位点对应，原理如图1-11;1. 5 新转录本;2 课题研究的目的及意义;3 材料与方法;3.2.2 Clean Reads数据的获得及信息分析 ;测序评估;3.3 可变剪接分析;3.3.2 可变剪接序列特征与机制分析;3.3.3 可变剪接事件分析;3.3.4 雄性不育相关可变剪接分析;3.4 新转录本分析;3.5 RT-PCR验证新转录本和可变剪接;3.6 qRT-PCR验证可变剪接事件;4 预期结果;5 进度安排;Thank You !