平面型氯蒽醌二聚体中分子间弱相互作用的理论研究-OALib.PDFVIP

2012 年 第 57 卷 第 25 期：2359 ~ 2365 《中国科学》杂志社 论 文 SCIENCE CHINA PRESS 平面型1-氯蒽醌二聚体中分子间弱相互作用的理论研究 * 王莹, 孙洁, 孙政, 孟令鹏, 郑世钧, 李晓艳  河北师范大学化学与材料科学学院, 石家庄 050024 * 联系人, E-mail: lixiaoyan326@163.com 2012-04-09 收稿, 2012-06-23 接受 国家自然科学基金、河北省自然科学基金(B2010000371, B2011205058)和河北省教育厅基金(ZD2010126)资助 摘要 运用密度泛函B3LYP 方法, 在6-311G(d,p)基组水平上对平面型1-氯蒽醌二聚体进行 关键词 构型优化, 得到了6 种稳定构型. 在MP2/6-311+G(d,p)水平上计算了这6 种构型分子的能量, 1-氯蒽醌二聚体 并进行了基组重叠误差(BSSE)校正. 通过分子静电势讨论了该类分子间弱相互作用的本质, 分子静电势 用“分子中原子(AIM)”理论对分子间化学键的性质进行了电子密度拓扑分析. 结果表明: 二 电子密度拓扑分析 弱相互作用 聚1-氯蒽醌的平行构型比T 型构型稳定, 1-氯蒽醌二聚体中分子间的相互作用都是具有静电 性质的弱相互作用, 电子受体的静电势变化总值可作为分子间化学键强弱的指标. 卤素由于具有独特的电荷分布, 可以吸引亲核 的分子间刚性三角结构在此类化合物中所起的作用. 性分子形成卤键[1~4]. 在生物大分子中, 卤键与氢键 的竞争可以决定大分子的二级或更高级的结构和功 1 计算方法 能[5~7]. 在蛋白质中, 分子结构通常是由卤键与氢键 采用了量子化学密度泛函 B3LYP/6-311G(d,p)方 相互连接组成的, 卤键与氢键的相互连接可能会形 法, 对 1-氯蒽醌二聚体分子进行了全参数构型优化, 成三角型的结构[6], 类似的三角型结构也经常出现在 共得到6 种平面稳定构型和2 种立体构型. 将得到的 一些晶体和小分子体系中[8~10]. 人们已经用X 射线衍 1-氯蒽醌二聚体和单体分子在 MP2/6-311+G(d,p)水 射、红外光谱、核磁共振等实验方法研究了一些同时 平上进行了能量校正, 并且采用 Boys 和 Bernardi[17] 包含氢键和卤键的分子体系[5,8], 实验结果一致证明 提出的完全均衡校正(CP) 来校正基组重叠误差 氢键与卤键利用相似的键能和不同的方向性, 可以 (BSSE). 运用“分子中原子(AIM)”理论[18]对 1-氯蒽醌 构造出一些稳定的分子间结构( 比如, 刚性三角型结 二聚体中的弱化学键进行了电子密度拓扑分析. 讨 构), 氢键和卤键之间是相互竞争或是共同协作的关 论了电子给体、电子供体的静电势值与分子间相互 [8~15] 系 . 作用能之间的关系. 上述所有量子化学计算均采用 最近, 运用扫描隧道显微镜观察到在Au 的(111) Gaussian 03[19]程序包完成, 电子密度拓扑分析采用 表面存在着由卤代蒽醌形成的超分子相互作用, 且 AIM2000 程序[20]完成. 在其二聚体中发现了由卤键、氢键组成的刚性三角 型结构[16]. 为了更好地理解该类结构, 本文运用电 2 结果和讨论 子密度拓扑分析理论研究了平面型 1-氯蒽