04VectorNTI的使用.pptVIP

Vector NTI的使用 * * 软件： Vector NTI 8.0 / 10.3 此课件仅是提纲，具体使用看上课时的演示 软件的安装 私有序列数据库的维护 限制性内切酶 DNA→Protein Contig 序列比对及多重比对 DNA/质粒图谱绘制 软件包含两大模块： 数据库模块和功能模块。数据库用于创建、导入导出、维护序列数据、载体数据、蛋白质分子数据、内切酶数据和寡核苷（一般是PCR引物）数据 功能模块主要包括：序列编辑、引物设计、模拟翻译、模拟电泳、序列比对、Contig、第三方附加模块等。 一、本机数据模块： 数据库分类 核酸分子 蛋白质分子 内切酶 寡核苷酸 电泳marker 引文 BLAST搜索结果 (PCR)分析结果 每类数据库又分为基库(MAIN)和子库(subset) 真正的数据都在基库里，子库只是用户自己建立的数据条目(item)的子集，里面是数据的联接不是数据本身，但是可以象操作数据一样进行直接操作； 对数据条目进行“拷贝”、“粘贴”操作，只会产生一个新的联接，不会产生新的数据；要产生数据复制，需要用“Duplicate”(数据条目上点右键)； 建议：只在子库里对数据进行操作，如果要修改数据，先“duplicate”一个拷贝，以免对原始数据产生不可恢复的影响； 分子与序列 在VNTI软件里，molecule与sequence并非等同，molecule除了包含sequence外，还包含有特性表(feature)等信息 私有序列库的维护 新建库 导入库 导入分子 导入序列 导出分子、序列、库 序列修改 序列的查看和编辑 序列片段的选取（精确方式，非鼠标操作） 序列的编辑 修改、插入、删除 互补序列 翻译（核酸序列→蛋白质序列） features的编辑修改 自定义显示、打印 临时为一段小序列生成互补序列 相关项目上点右键 限制性内切酶 排序与查找 新建一个内切酶 酶切位点图谱 图上的结果不是完整的结果，左边的分析报告才是完整的，明确指明位点个数为“0”才是“无该位点”，因为位点太多(大于5)或该酶未列入分析项目中，都有可能导致不显示出来； 酶切片段 完全酶切 部分酶切 部分酶切 部分酶切 部分酶切 * * *