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QTL作图中零假设检验统计量分布特征及LOD临界-数量遗传课题组
作物学报 ACTA AGRONOMICA SINICA 2013, 39(1): 111 /zwxb/
ISSN 0496-3490; CODEN TSHPA9 E-mail: xbzw@
DOI: 10.3724/SP.J.1006.2013.00001
QTL 作图中零假设检验统计量分布特征及LOD 临界值估计方法
孙子淇 李慧慧 张鲁燕 王建康*
/ / CIMMYT , 100081
: QTL , LOD ,
, QTL (LRT)
LOD
, QTL QTL ,
LRT , QTL ;
, LOD ,
, BC1RIL F2 , BC1 , F2 , ,
LOD ; QTL ,
Bonferroni , , ,
, LOD
: QTL ; ; LOD ; ; ;
Properties of the Test Statistic under Null Hypothesis and the Calculation of
LOD Threshold in Quantitative Trait Loci (QTL) Mapping
*
SUN Zi-Qi, LI Hui-Hui, ZHANG Lu-Yan, and WANG Jian-Kang
Institute of Crop Sciences / National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement, Chinese Academy of Agricultural Sciences /
CIMMYT China Office, Beijing 100081, China
Abstract: Selecting an appropriate LOD threshold is of great interest in QTL mapping studies. Many approaches can be consid-
ered to calculate the critical value throughout a genome, such as simulation-based method, analytical approximation, and empiri-
cal method based on permutation test. Many tests are conducted in QTL mapping, which are not mutually independent because the
linkage relationship of adjacent markers on chromosomes. In order to d
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