核苷酸序列比对在生物系统发育研究中的应用.pdfVIP

Act a Zoot axonomica Sinica , 30 (2) : 281 - 286 (Ap r . , 2005) ISSN 动物分类学报 核苷酸序列比对在生物系统发育研究中的应用 谢 　强 　卜文俊 南开大学生命科学学院昆虫学研究所昆虫分子系统学实验室　天津 　30007 1 ( ) 摘 　要 　作为确定分子数据初级同源性 p rimary homology 的过程 , 比对的重要性在于后续算法的选择 。本文对其 在生物系统发育研究中的作用及其基本步骤与算法做了简要说明; 从理论与实践相结合的角度介绍了使用最为广泛 的软件 , 讨论了其中的空位 ( gap ) 问题 、参数问题和比对结果校正等问题; 并且对此领域中前沿的基因组比对研 究进展做了概述 。 关键词 　核酸序列 , 比对 , 简约 , 似然 , 距离 , 基因组.