[生物学]第八章 基因定位与遗传作图分析1.pptVIP

制作：杨先泉 第三节 基因定位与连锁遗传图Section 3.3 Gene Location Linkage Map (基因定位的含义与层次) 一、连锁分析的方法 二、干扰和符合 三、连锁遗传图 基因定位(gene location/localization) 基因定位(gene location/localization)：确定基因在染色体上的相对位置和排列次序。 根据两个基因位点间的交换值能够确定两个基因间的相对距离，但并不能确定基因间的排列次序。 例： 玉米糊粉层有色C/无色c基因、籽粒饱满Sh/凹陷sh基因均位于第九染色体上；且C-Sh基因间的交换值为3.6%。 因此，一次基因定位工作常涉及三对或三对以上基因位置及相互关系。 两对基因间的排列次序 根据上述信息可知： C-Sh间遗传距离为3.6个遗传单位； 但不能确定它们在染色体上的排列次序，因而有两种可能的排列方向，如下图所示： 基因定位的层次 广义的基因定位有三个层次： 染色体定位 染色体臂定位 连锁分析(linkage analysis) 。 一、 连锁分析的方法 基因连锁分析的主要方法： (一)、两点测验(two-point testcross) 通过三次测验，获得三对基因两两间交换值、估计其遗传距离；每次测验两对基因间交换值；根据三个遗传距离推断三对基因间的排列次序。 (二)、三点测验(three-point testcross) 一次测验就考虑三对基因的差异，从而通过一次测验获得三对基因间的距离并确定其排列次序。 两点测验：步骤(1/3) 1. 通过三次亲本间两两杂交，杂种F1与双隐性亲本测交，考察测交子代的类型与比例。 例：玉米第9染色体上三对基因间连锁分析： 子粒颜色： 有色(C)对无色(c)为显性； 饱满程度： 饱满(SH)对凹陷(sh)为显性； 淀粉粒： 非糯性(Wx)对糯性(wx)为显性. (1).(CCShSh×ccshsh)F1 × ccshsh (2).(wxwxShSh×WxWxshsh)F1 × wxwxshsh (3).(wxwxCC×WxWxcc)F1 × wxwxcc 两点测验：步骤(2/3) 2. 计算三对基因两两间的交换值估计基因间的遗传距离。 两点测验：步骤(3/3) 3. 根据基因间的遗传距离确定基因间的排列次序并作连锁遗传图谱。 C-Sh: 3.6 Wx-Sh: 20 Wx-C: 22 两点测验：局限性 1. 工作量大，需要作三次杂交，三次测交； 2. 不能排除双交换的影响，准确性不够高。 当两基因位点间超过五个遗传单位时，两点测验的准确性就不够高。 三点测验：步骤(1/7-2/7) 仍以玉米C/c、Sh/sh、Wx/wx三对基因连锁分析为例，在描述时用“+”代表各基因对应的显性基因。 1. 用三对性状差异的两个纯系作亲本进行杂交、测交： P: 凹陷、非糯性、有色 × 饱满、糯性、无色 shsh ++ ++ ++ wxwx cc ↓ F1及测交: 饱满、非糯性、有色×凹陷、糯性、无色 +sh +wx +c shsh wxwx cc ↓ 2. 考察测交后代的表现型、进行分类统计。 三点测验：步骤(3/7-4/7) 3. 按各类表现型的个体数，对测交后代进行分组； 4. 进一步确定两种亲本类型和两种双交换类型； 三点测验：步骤(5/7) 5. 确定三对基因在染色体上的排列顺序。 用两种亲本型配子与两种双交换型配子比较：双交换配子与亲本型配子中不同的基因位点位于中间。 如：+ wx c与sh wx c相比只有sh位点不同，因此可以断定sh位点位于wx和c之间； 同理，sh + +与+ + +相比也只有sh位点不同，也表明sh位点位于wx和c之间。 基因间排列顺序确定 三点测验：步骤(6/7) 6. 计算基因间的交换值。 由于双交换实际上在两个区域均发生交换，所以在估算每个区域交换值时，都应加上双交换值，才能够正确地反映实际发生的交换频率。 三点测验：步骤(7/7) 7. 绘制连锁遗传图。 Sh位于wx与c之间； wx-sh: 18.4 sh-c: 3.5 wx-c:21.9。 二、 干扰和