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第 一 篇
;蛋白质的结构与功能; 本章主要内容;一、蛋白质概念;? 组成蛋白质的元素; 各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16%。 ;一、氨基酸 —— 组成蛋白质的基本单位;共同特点:
① 除脯氨酸外,在a-C上皆有一个氨基,故称a-氨基酸;
② 均为L-氨基酸。;氨基酸的D-型和L-型是与甘油醛相比较而得。通常把含C基团放在纵轴上,看H的位置,左边为D型,右边为L型。;H;1.根据氨基酸的化学结构分为脂肪族,芳香族和杂环族三类。
2.根据氨基酸的R基极性分为: 非极性R基氨基酸,不带电荷极性氨基酸,带电荷极性氨基酸
3.根据氨基酸分子中所含氨基和羧基数目的不同分:中性、碱性、酸性氨基酸
4.根据氨基酸的R基物理性质,与水的相互作用分为: 疏水氨基酸,亲水氨基酸
;非极性疏水性氨基酸 7
极性中性氨基酸 8
酸性氨基酸 2
碱性氨基酸 3;甘氨酸 glycine Gly G 5.97;色氨酸 tryptophan Trp W 5.89;天冬氨酸 aspartic acid Asp D 2.97;几种特殊氨基酸;? 半胱氨酸 ;胱氨酸;(二)氨基酸的理化性质;pH=pI;①当氨基酸仅有2个可解离基团时:;②当氨基酸仅有3个可解离基团时,可写出其电离式后取兼性离子两边的pK值的平均值:
;等电点计算
①侧链为非极性基团或虽为极性基团但不解离的氨基酸:pI=?(pK1+pK2)
②酸性氨基酸(Glu、Asp)及Cys:pI=?(pK1+pKR)
③碱性氨基酸(Lys、Arg、His):pI=?(pK2+pKR);2. 紫外吸收 ;3. 茚三酮反应(定量分析) ;
茚三酮反应;二、肽;+;* 肽是由氨基酸通过肽键缩合而形成的化合物。;N 末端:多肽链中有自由氨基的一端
C 末端:多肽链中有自由羧基的一端;N末端;(二) 几种生物活性肽;GSH过氧化物酶;功能
(1)巯基为体内重要的还原剂,保护蛋白质或酶中的巯基免受氧化。
(2)分解H2O2。
(3)解毒功能:巯基的亲核性可与外源性亲电子毒物如致癌剂或药物结合。; 体内许多激素属寡肽或多肽;三、蛋白质的分类 ;蛋 白 质 的 分 子 结 构The Molecular Structure of Protein;蛋白质的分子结构包括
一级结构(primary structure)
二级结构(secondary structure)
三级结构(tertiary structure)
四级结构(quaternary structure);定义
蛋白质的一级结构(primary structure)是指多肽链中氨基酸的排列顺序。;一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础。;二、蛋白质的二级结构;(一)肽单元(peptide unit);1.肽单位是一个刚性平面:
肽键中的C-N键长(0.132nm)介于C-N
的单键长(0.149nm)和双键长(0.127nm)之
间,故具有部分双键性质,不能自由旋转?肽
单位的6个原子处于1个平面上?肽平面。
;参与肽键的6个原子C?1、C、O、N、H、C?2位于同一平面,C?1和C?2在平面上所处的位置为反式(trans)构型,此同一平面上的6个原子构成了所谓的肽单元 (peptide unit) 。;3.相邻肽平面构成二面角:
一个碳原子相连的两个肽平面,由于N1
-C ?和C ? -C2两个键为单键,肽平面可
别围绕这两个键旋转,从而构成不同的构象。; 蛋白质二级结构的主要形式;(二) ?-螺旋;;1.β-折叠(β-pleated sheet):为由两条或多条几乎完全伸展的肽链平行排列,通过链间的氢键交联而形成的。肽链的主链呈锯齿状折叠构象。
;2.肽链走向分平行和反平行两种。;α-螺旋结构与β-折叠结构的比较 ;(四)?-转角和无规卷曲;?-转角;2.无规卷曲( random coil ) :
无规卷曲是用来阐述没有确定规律性的那部分肽链结构。 ;;;(六)氨基酸残基的侧链对二级结构形成的影响;1.多个酸性氨基酸或碱性氨基酸在同一肽
段内?影响α-螺旋的形成。
2.Asn、Leu的侧链很大?影响α-螺旋的形成。
3.Pro使α-螺旋中断。
4.氨基酸残基的侧链小的肽段才能互相靠
近,有利于β-折叠的形成。;三、蛋白质的三级结构;; 肌红蛋白 (Mb) ;纤连蛋白分子的结构域 ;(三)分子伴侣;亚基之间的结合力主要是疏水作用,其次是氢键和离子键。;同二聚体
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