第二章植物新品种来源精品.ppt

* 开发SSR引物序列示意图 建立DNA文库 酶切 杂交 阳性克隆 测序 设计引物 * 用两种能产生粘性末端的限制性内切酶将基因组DNA切割成分子量大小不等的限制性片段 （四）AFLP标记(扩增片段长度多态性 ) 将这些片段和与其末端互补的已知序列的接头连接 引物5’端与接头和酶切位点序列互补，3’端在酶切位点后增加1～3个选择性碱基 确保只有一定比例的限制性片段 被选择性地扩增，经变性聚丙烯 酰胺凝胶电泳分辨。 * 1、AFLP揭示的DNA多态性是酶切位点和其后的选择性碱基的变异。扩增片段的谱带数取决于采用的内切酶及引物3’端选择碱基的种类、数目和所研究基因组的复杂性。 2、AFLP是限制性酶切与PCR结合的一种技术，具有RFLP技术的可靠性和PCR技术的高效性，可以在一个反应内检测大量限制性片段，一次可获得50～100条谱带的信息。 3、主要不足：相对比较费时耗财。 AFLP标记特点 * 1、单核苷酸多态性(SNP) 是指在基因组上单个核苷酸的变异；一般而言,SNP 是指变异频率大于1%的单核苷酸变异。在人类基因组中大概每1000 个碱基就有一个SNP。 （五）SNP标记特点 * 2、SNP在CG序列上出现最为频繁,而且多是C转换为T ,原因是CG中的C常为甲基化的,自发地脱氨后即成为胸腺嘧啶。 3、SNP在基因组内可以划分为两种形式: （1）遍