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- 2018-03-29 发布于广东
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南京大学分子生物学第24讲
(四)DNA的甲基化和去甲基化 1,真核生物基因组DNA甲基化 (1)真核生物DNA甲基化位点 (2)基因的甲基化状态 (3)DNA的甲基化状态 (4)用于甲基化研究的限制性内切酶(图9-8) 2,甲基化DNA的结合蛋白 3,DNA甲基化的转录抑制 (1)哺乳动物以CpG甲基化程度为标准的启动子分类 A,CpG岛启动子 B,组织特异性启动子 (2) DNA甲基化与基因表达活性的负相关性 4,DNA去甲基化位点的特点 (1)范围和DNA酶I优先敏感区域十分吻合 (2)只有一小部分CG二核苷酸对的去甲基化与基因激活有关,它们位于对基因表达关系十分密切的序列中 5, DNA甲基化位点的维持及去甲基化位点的产生 6, DNA甲基化/去甲基化对基因活性调控的相对性 (1) DNA甲基化程度因物种而异 (2) DNA甲基化/去甲基化对不同基因活性有不同影响 第四节转录水平的调控 一、Britten-Davidson模型 (一)保证各种细胞类型表达“正确”的基因组合的方法 1,多拷贝基因的组织特异性调控 2,单拷贝基因的复合控制系统 (二)真核生物基因表达的复合控制系统 1,真核生物基因表达调控的基本要素(图9-9) (1)结构基因 (2)接受位点 (3)综合者基因 (4)感受位点 (5)感受信号:由感受位点接受的基因表达调控信号 2, Britten-Davidson调控模型 (图9-10) (1)一个结构基因可以接受不同感受信号的调控 (2)一个感受信号可以协调不同结构基因的表达 (3)复合控制系统基本要素之间的关系(仅供参考) 二、基因调控的顺式作用成分 (一)启动子: 1,TATA框 2,上游启动子成分(UPE):主要控制转录起始频率 (1)CCAAT框 (CCAAT box) (2)GC框(GC box) (3)UPE的作用特点 (二)真核生物的增强子 1,增强子的特点 2,构成增强子的基本单元(以SV40为例) (1)72bp正向重复序列 (2)增强子成分 (3)增强子元 3,增强子的组织结构及作用机制 (1)增强子元水平上的二元组织方式 (2)增强子成分水平上的二元组织方式 (3)增强子所包含的两个水平上的二元组织方式的意义 (4)增强子的远程作用 4,增强子的种类 (1)细胞特异性增强子 (2)诱导性增强子 5,启动子和增强子的相似性 (1)作用机理的相似性 (2)DNA序列及反式作用因子的相似性 (3)启动子和增强子的功能相似性 (三)沉默子(silencer) 1,作用 2,特点 (四)转座元 三、基因调控的反式作用因子 (一)TATA框结合蛋白 1,一般性启动子 2,RNA聚合酶II起始基因转录所必需的4种辅助蛋白因子 (二)GC框结合蛋白 1,SP1的特征 (1)是1.05×105的蛋白质单体 (2)结合位点:能与DNA双链中一条链上包括GGGCGG在内约20bp的序列特异结合。结合于GC框的大沟中,各SP1均位于DNA双螺旋的同一侧 (3)可以提高转录效率10~25倍 (4)作用是双向的 (5)作用无组织特异性 2,不同基因启动子的GC框 (1)具GC框的基因 猿猴病毒SV40的早、晚期基因,金属硫蛋白,ADP核糖基转移酶等 (2)不同基因GC框的数量、位置、排列方向不同(图9-16) (3)GC框的一致序列 (三)CCAAT框结合蛋白 1, CCAAT框多数是单独起作用的 2, CCAAT框结合蛋白 包括CTF,腺病毒核因子NF-1,NF-Y等 3, CTF与NF-1是同一种蛋白 CTF(NF-1)的双重作用:既是转录因子,又是腺病毒DNA复制所必需的 4,CTF(NF-1)的作用无组织特异性 (四)RNA聚合酶III及其下游启动区结合蛋白 1,TFIII A 2,TFIII B 2,TFIII C (五)其他转录因子 1,概况 (1)应答元件:能与某个(类)专一蛋白因子结合,从而控制基因特异表达的DNA上游序列称为应答元件 (2)常见的应答元件有:热休克应答元件(heat shock response element,HSE),糖皮质应答元件(glucocorticoid response element,GRE),金属应答元件(metal response element,MRE)等 调控因子 应答元件 DNA序列 结合蛋白 热休克 HSE CNNGAANNTCCNNG HSF 糖皮质 GRE TGGTACAAATGTTCT 受体 镉 MRE CGNCCCGGNCNC ? 佛波酯 TRE TGACTCA AP1 血清 SRE CCATATTAGG SRF 2,热休克因子HSF (
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