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珊瑚与海绵共附生放线菌多样性及其产生芳香类聚酮化合物的研究.pdf
上海交通大学
博士后出站报告
珊瑚与海绵共附生放线菌多样性
及其产生芳香类聚酮化合物的研究
合作导师 奎麦勇夔握
流动站生金辩堂撞丕堂医生堑堂
报告提交El期 至Q羔墨生垒且
摘要
珊瑚与海绵共附蝴菌多样性及其产生芳香类聚酮化合物的研究
摘要
随着抗生素的广泛使用,病原微生物的抗药性和耐药性问题日益严重,同时,新型病历再
体层出不穷,人们对新型抗生素的需求己迫在眉睫。目前市场上的抗生素中,聚酮类化合物
居六大类天然产物之首。芳香类聚酮化合物是Ⅱ型聚酮合成酶参与合成的一大类化合物的
总称,化学结构多样,包括蒽环类、角葸环类、金霉酸类、异色烷醌类及四环素类等。芳香
类聚酮已经表现出广泛的生物活性,包括抗细菌、抗真菌、抗病毒、抗肿瘤、抗结核、免疫
抑制等功能,具有良好的应用前景。现有的芳香类聚酮化合物主要来源于陆生放线菌,尤其
是链霉菌。经过几十年的开发,陆生放线菌己进入开发瓶颈期。海洋面积广阔,生境特殊,
海洋环境的压力、盐分、温度和养分变化多端,使海洋微生物进化出独特的生理生化特征和
生存竞争模式,它们可以产生普通陆生微生物中观察不到的丰富的次级代谢产物。2l世纪
以来海洋微生物已成为生物活性物质开发的新目标,而海洋放线菌尤其吸引人们的关注。近
几年,从海绵和海蛤来源的放线菌中已经成功分离到几个新的芳香类聚酮化合物,表明了从
海洋共附生放线菌中开发芳香类聚酮的潜力。
我国海域辽阔,生物资源丰富。早在上世纪,化学工作者就从海绵和珊瑚等海洋生物中
分离提取化合物,取得了卓越的成果。然而,海洋生物来源的化合物在药物研发中常遇到药
源供给不足的问题,严重制约了活性先导化合物的最终商品化。此后,海洋生物活性物质共
生微生物来源的观点得到认同。从2005年起,国内展开针对海绵共附生放线菌的研究,主
要涉及分离培养,生物活性检测和放线菌群落组成分析。此后,国外展开对珊瑚共生细菌的
研究,揭示了放线菌在珊瑚粘液层和组织中都有分布,部分菌株表现出好的抑菌活性。这些
研究为我们从海洋共附生放线菌中分离活性代谢产物提供了理论依据。在今后的一段时间
内,人们将更为关注如何充分挖掘这些放线菌的应用价值。
本文综合运用微生物学,分子生物学,生物信息学及天然产物化学等多个学科的方法技
术,针对我国的珊瑚和海绵共附生放线菌,进行放线菌多样性及其产生芳香类聚酮化合物的
研究,在以下五个方面取得了重要成果或发现:
(1)提出了在功能基因分析指导下针对性开发芳香类聚酮化合物的思路,并且沿用这一思
路对个别放线菌菌株进行研究,最终从一株珊瑚来源小单孢菌的次级代谢产物中发现了一个
珊瑚与海绵共附生放线菌多样性及其产生芳香类聚酮化合物的研究
B类似物并预测了其化学结构。
Jadomycin
8个属的放线
和Streptomyces共15个属的放线菌。研究通过培养和免培养技术分别揭示了我国软珊瑚及
石珊瑚的共附生放线菌多样性。
(3)运用分离培养技术,从12种南海海绵中分离到17个放线菌属(Arthrobacter,
4个稀有放
线菌属均为首次从海绵中培养,研究扩充了海绵共附生放线菌的多样性。
(4)从分离到的珊瑚与海绵共附生放线菌中筛选出32株具有芳香类聚酮合成能力的菌株,
提供了菌株资源。
(5)通过对Ⅱ型聚酮合成途径中关键酶的序列进行系统进化分析预测菌株合成芳香类聚酮
的化学类型,选取6株菌(I株珊瑚来源的小单孢菌,I株海绵来源的糖多孢菌和4株海绵
来源的链霉菌)进行小量发酵,最终从一株小单孢菌的发酵液提取成分中指认出一个角蒽环
B类似物,另外从一株糖多孢菌的发酵液提取成分中发现一个异色烷醌
类化合物Jadomycin
类化合物Medermycin类似物。
关青毫阅:珊瑚共附生放线菌;海绵共附生放线菌;芳香类聚酮化合物
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