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马铃薯纺锤形块茎类病毒spindletuberviroid2015年-ippc
本诊断规程于2015 年1 月由标准委代表植检委通过。
本附件是ISPM 27 号标准规定的一部分。
ISPM 27
附件7
国际植物检疫措施标准
ISPM 27 号标准诊断规程
DP 7 :
马铃薯纺锤形块茎类病毒 (spindle tuber viroid )
(2015 年)
目录
1. 有害生物信息 3
2. 分类信息 4
3. 检测 4
3.1 抽样 7
3.2 生物学检测 7
3.3 分子检测 8
3.3.1 样品制备 8
3.3.2 核酸提取 9
3.3.3 马铃薯纺锤形块茎类病毒属的通用分子检测方法 11
R 11
用DIG 标记的cRNA 探针杂交 11
使用Verhoeven 等 (2004 )引物的常规RT-PCR 12
使用GenPospi 检测的实时RT-PCR (Botermans 等,2013 ) 13
3.3.4 具有较高特异性的PSTVd 分子检测方法 15
使用Shamloul 等(1997)引物的常规RT-PCR 15
使用Boonham 等(2004 )引物的实时RT-PCR 15
实时RT-PCR (Plant Print Diagnòstics kit ) 16
3.4 分子检测的对照 17
3.5 常规和实时RT-PCR 结果的解释 19
3.5.1 常规RT-PCR 19
《国际植物保护公约》 第1 页共32 页
DP 7 限定有害生物诊断规程
3.5.2 实时RT-PCR 19
4. 鉴定 19
4.1 测序与序列分析 20
5. 记录 21
6. 获取进一步信息的联系点 21
7. 致谢 22
8. 参考文献 22
第2 页共32 页 《国际植物保护公约》
限定有害生物诊断规程 DP 7
1. 有害生物信息
类病毒是没有蛋白质外壳,共价闭合的单链环状 RNA 分子,长度为 239 -401
个碱基对,由寄主酶复制(Hammond Owens ,2006 )。马铃薯纺锤形块茎类病毒
(PSTVd ;马铃薯纺锤形块茎类病毒属(Pospiviroid ))通常长359 个碱基对,但有
报道称有的 PSTVd 分离物含有 341 -364 个碱基对 (Wassenegger 等,1994;
Shamloul 等,1997;Jeffr
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