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华细辛实时荧光定量pcr分析中内参基因的选择
生物技术通报
·研究报告· BIOTECHNOLOGY BULLETIN ( )
2017, 33 11 :174-179
华细辛实时荧光定量 PCR 分析中内参基因的选择
1,2 2 2 2 1 2
赵晓冰 潘磊 柳威 林懋怡 李宏庆 刘忠
(1. 华东师范大学生命科学学院,上海 200241 ;2. 上海交通大学药学院,上海 200240)
摘 要 : 选择合适的内参基因是准确分析目标基因表达水平变化的重要条件。选取SAND-1、ACT、18SrRNA、CYP2、
GAPDH、TUB 6 个常用的内参基因作为候选内参基因,利用实时荧光定量PCR 技术,通过geNorm、NormFinder、BestKeeper、
Delta CT 等软件分析和评价6 个候选内参基因在华细辛营养生长期、花期和花后期等不同生长阶段的根、根茎、叶片、叶柄等不
同组织中的表达稳定性,筛选适宜华细辛不同生长阶段不同组织基因表达水平分析的内参基因。结果表明,18S rRNA 在华细辛所
有样品中表达最为稳定,是进行华细辛基因表达水平分析的适宜的内参基因。研究结果可为华细辛重要活性成分生物合成途径相
关基因的功能分析,以及基因差异表达的研究提供有效的校正工具,确保基因表达分析结果的准确性与可靠性。
关键词 : 华细辛 ;内参基因;geNorm ;NormFinder ;BestKeeper ;Delta CT
DOI :10.13560/ki.biotech.bull.1985.2017-0352
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Screening of Reference Genes for Quantitative Real time PCR Analysis
in Asarum sieboldii
1,2 2 2 2 1 2
ZHAO Xiao-bing PAN Lei LIU Wei LIN Mao-yi LI Hong-qing LIU Zhong
(1. School of Life Science ,East China Normal University ,Shanghai 200241 ;2. School of Pharmacy ,Shanghai Jiao Tong University ,
Shanghai 200240 )
Abstract: Selecting appropriate reference gene is key step for the accurate analysis of the expression variations of target genes. Using
several common-used reference genes of SAND-1,ACT,18S rRNA,CYP2,GAPDH and TUB as candidate genes and quantitative real-
time PCR analysis of gene expression,the expression stabilities of these 6 cand
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