一种新的拓扑参数及其蛋白质网络关键节点识别.pdfVIP

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2018-04-07 发布于北京
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一种新的拓扑参数及其蛋白质网络关键节点识别.pdf

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第26卷第8期计算机应用研究 V01．26No．8 Researchof Aug．2009 2009年8月 Application Computers 一种新的拓扑参数及其蛋白质网络关键节点识别宰黄海滨1’，王建新1，邵平L2 (1．中南大学信息科学与工程学院，长沙410083；2．玉林师范学院数学与计算机科学系，广西玉林537000) 摘要：针对已有拓扑参数对关键蛋白识别度不高的现状，根据蛋白质网络的特点，结合参数计算方法，提出一个新的用来描述节点重要性的拓扑参数——点覆盖参数。为了避开该参数精确求解方法中可能出现的NP-难问题，从稀疏网络出发，在研究低度点核化技术的基础上，将确定算法与非确定算法相结合，提出基于随机核化的快速算法(A—R—K算法)。实验结果显示，所获得的点覆盖参数不仅可以有效地描述网络节点的拓扑重要性，而且其关键蛋白识别度也明显高于其他参数。．关键词：拓扑参数；蛋白质网络；关键节点；模式识别；参数计算中图分类号：TP301．6 文献标志码：A 文章编号：1001—3695(2009)08．2842—05 doi：10．3969／j．jssn．100l-3695．2009．08．011 for nodein networks New ofessential topologicalparameterrecognition protein ‘HUANG Hai．binl．一，WANGJian．xinl，SHAOPin912 Somh (1．SchoolofInformationScience＆Engiwedng，CentralUniversity，Changsha Normal Science，YulinCollege，YulinGuangxi537000，China) based thelow intheidentificationofessential on Abstract：Forrecognitiondegree protein topologicalparameter，thispaper anew cover the ofanodeinanetworkinvirtueof describe proposedparameter·vertexparameter(vp)toimportance parame· terized avoidtheNP-hardwhich metinthe of the withexact computation．To probable processgettingparameter methods， studiedthekernelizationlow nodesandthecombinationofexactandno-exact tothe by degree algorithmsaccordingsparseness of f