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第八章节酶定向进化.ppt
*/169 */169 接头与接头会彼此以粘性末端接在一起,影响与DNA片段的连接。 ③优点: 连上后就能用。 ④缺点: 先用小牛肠碱性磷酸酶(CIP)处理接头,水解掉其5’端的磷酸,防止自我连接。 (以后再用T4多核苷酸激酶加上磷酸。) ⑤防止自我连接 8.3.2 酶基因突变的定向选择--基因重组 */169 5‘p-GATCCCGG-OH HO-GGCC-P P-CCGG-OH HO-GGCCCTAG-P5’ CCGGGATCCCGG-OH HO-GGCCCTAGGGCC5’ 接头之间不能形成磷酸二酯键自我连接! 5‘GATCCCGG-OH HO-GGCC5’ 5’CCGG-OH HO-GGCCCTAG5’ CIP处理 -OH HO- */169 突变文库的组装是将重组DNA转入受体细胞或包装成有感染活性的重组噬菌体的过程。 对于重组质粒载体可以通过细胞转化等方法将重组DNA转入受体细胞,形成突变基因文库 对于重组噬菌体DNA载体,需要用噬菌体外壳蛋白将重组DNA进行包装,成为有感染活性的重组噬菌体,而形成基因文库。 8.3.3 酶基因突变的定向选择 (三)构建突变基因文库 */169 大肠杆菌转化(transformation) E. coli 感受态细胞 感受态制备 0℃,0.1MCaCl2 加入质粒 42℃热激 90 s, 立即冰浴 富裕培养 抗性筛选 LB-抗生素 8.3.3 酶基因突变的定向选择--构建突变基因文库 */169 in vitro packaging of lambda phage */169 重组λ噬菌体转导(transduction) 8.3.3 酶基因突变的定向选择--构建突变基因文库 */169 重组λ噬菌体转导(transduction) */169 根据定向进化的目的要求,在一定的环境条件下进行筛选,从突变基因文库中选取得到所需的突变基因。 突变基因文库 质粒载体 噬菌体载体 转化 转导 目的基因 筛选 8.3.4 酶基因突变的定向选择--突变基因的筛选 */169 (一)定向选择环境条件的设定 根据定向进化的设定选择环境 在每一次“突变——筛选”的循环中加以调整选择环境 (1)提高酶的热稳定性: 较高温度下培养重组细胞,每次循环提高温度。 (2)提高β-内酰胺酶的催化效率: 一定浓度的β-内酰胺类抗生素中培养,每次提高浓度 8.3.4 酶基因突变的定向选择--突变基因的筛选 */169 细菌 诱发突变的因素 50 0C培养 突变体库 选择压力 耐受型突变体 一定浓度的β-内酰胺类抗生素 8.3.4 酶基因突变的定向选择--突变基因的筛选 (一)定向选择环境条件的设定 */169 (二)高通量筛选技术 高通量筛选技术要求: 通量大、效率高,在较短时间内简便的判断出正突变基因,并易于排出那些无效的突变基因。 常用高通量筛选方法 平板筛选法 荧光筛选法 噬菌体表面展示法 细胞表面展示法 核糖体表面展示法 8.3.4 酶基因突变的定向选择--突变基因的筛选 */169 (二)高通量筛选技术 */169 1、平板筛选法 平板筛选方法是将含有随机突变基因的重组细胞,涂布在平板培养基上,在一定条件下培养,依据重组菌细胞的表型鉴定出有效突变基因的筛选方法。 特点: 简便、快速、直观、容易控制和调整环境条件 依据: 重组细胞的表型 细胞生长情况 颜色变化情况 透明圈情况 8.3.4 酶基因突变的定向选择--突变基因的筛选 高通量筛选方法 */169 (1)依据细胞生长情况筛选突变基因 热稳定性:温度梯度和高温环境 抗生素耐受性:抗生素浓度梯度 pH稳定性: pH梯度 极端环境:高盐、低温、 高浓毒物质 */169 (2)依据颜色变化筛选突变基因 反应产物显色 蓝白斑筛选(Blue white screening): lacZ’ Am N2H ?片段 COOH ?片段 */169 (LacZ基因 N端序列) 插入片段 (LacZ基因失活) LacZ基因 C端序列 LacZ酶 ?-galactosidase Blue/ white screening or Lac selection 诱导物:IPTG 底物:X-gal */169 */169 磷酸酯酶水解硝基酚磷酸生成黄色硝基酚; */169 Homogenized activated sludge sample cultured on 1/10-strength LB plates amended with CPQP and viewed with (A) white light and (B) fluor
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