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生物化学蛋白质课件经典案例.ppt
; 第一节 概 述;具体生物学意义:;三、蛋白质的组成; ; 除了上法外,还有
紫外比色法 双缩脲法 Folin—酚 考马斯亮兰G—250比色法
(条件:蛋白质必须是可溶的); 第二节 氨基酸化学;不带电形式;3、常见蛋白质氨基酸的分类;(Gln, Q);2)按R的极性性质;注:二十种氨基酸的结构特点
支链氨基酸:缬氨酸、亮氨酸,异亮氨酸
含羟基的氨基酸:丝氨酸、苏氨酸
含硫的氨基酸:半胱氨酸(含巯基)、甲硫氨
酸(含硫甲基)
含苯环的氨基酸:苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸
含胍基的氨基酸:精氨酸
含咪唑基的氨基酸:组氨酸
亚氨基酸:脯氨酸
含酰胺的氨基酸:天冬酰胺、谷氨酰胺
含吲哚基的氨基酸:色氨酸
含ε-氨基的氨基酸:赖氨酸;胶原蛋白中的Lys侧链氧化时能形成很强的分子间(内)交联。
Arg的胍基碱性很强,与NaOH相当。
His是一个弱碱,是天然的缓冲剂,它往往存在于许多酶的活性中心。
非极性aa一般形成蛋白质的疏水核心,带电荷的aa和极性aa位于表面。
酶的活性中心:His、Ser、Cys; ; ;6、非蛋白质氨基酸; ; ; ;在pH2.34和pH9.60处,Gly具有缓冲能力。
?
起点: 100% Gly+ 净电荷:+1
第一拐点: 50%Gly + ,50%Gly± 平均净电荷:+0.5
pH=pK+lg[Gly±]/[Gly+] = pK1 = 2.34
第二拐点: 100%Gly± 净电荷:0 等电点pI
第三拐点: 50%Gly± ,50%Gly- 平均净电荷:-0.5
pH=pK2+lg[Gly-]/[Gly±]=pK2=9.6
终点: 100% Gly- 净电荷:-1;甘氨酸滴定曲线;; ; ;;反应要点
A.该反应由NH2与COOH共同参与
B.茚三酮是强氧化剂
C.该反应非常灵敏,可在570nm测定吸光值
D. 测定范围:0.5~50μg/ml
E.脯氨酸(或羟脯氨酸)与茚三酮直接生成黄色物质(不释放NH3)
应用:
A.氨基酸定量分析(先用层析法分离,再测定CO2的量)
B.氨基酸自动分析仪:
用阳离子交换树脂,将样品中的氨基酸分离,自动定性定量,记录结果。; ;氨基酸的甲醛滴定 ;小结:; (3) 与2,4-二硝基氟苯(DNFB)反应; ;Sanger降解法的改进方法--- DNS-Edman降解法
用DNS(二甲基氨基萘磺酰氯)测定N端氨基酸
原理DNFB法相同
但水解后的DNS-氨基酸不需分离,可直接用???泳或层析法鉴定
由于DNS有强烈荧光,灵敏度比DNFB法高100倍,比Sanger法高几到十几倍
可用于微量氨基酸的定量
; 由Edman于1950年首先提出为α- NH2的反应用于N末端分析,又称Edman降解法; ;(5)侧链R基参加的反应;重要反应:;酪氨酸的酚基在3和5位上容易发生亲电取代反应,例如发生碘化或硝化,分别生成一碘酪氨酸和二碘酪氨酸或一硝基酪氨酸和二硝基酪氨酸:;与重氮盐结合生成桔黄色的化合物:;组氨酸的侧链咪唑基与重氮苯磺酸也能形成相似的化合物,但颜色稍有差异,是棕红色。;色氨酸的侧链吲哚基在温和条件下可被N—溴代琥珀酰亚胺氧化。此反应可用于分光光度法测定蛋白质中色氨酸的含量,并能在色氨酸和酪氨酸残基处选择性化学断裂肽键。;生成的侧链带有正电荷(ε-+NH3),它为胰蛋白酶水解肽链提供了一个新位点,这对氨基酸顺序测定是很有用的。同时此反应也可用来保护肽链上的-SH基、以防止被重新氧化为二硫键。;半胱氨酸可与二硫硝基苯甲酸(缩写为DTNB)或称Ellman氏试剂发生硫醇—二硫化物交换反应:;硫基很容易受空气或其他氧化剂氧化。
硫醇一般遇到的只有两种氧化衍生物:二硫化物和磺酸。;丝氨酸、苏氨酸和羟脯氨酸的OH基能与酸结合成酯。在生物体蛋白质中,丝氨酸常与磷酸结合,酪蛋白中含有大量的丝氨酸磷酸酯。 ;;
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