蛋白质分子中氨基酸的排列顺序主键.ppt

第二节 蛋白质的分子结构 蛋白质的一级结构 蛋白质的二级结构 蛋白质的三级结构 高级结构 蛋白质的四级结构 一、蛋白质的一级结构 primary structure 概念：蛋白质分子中氨基酸的排列顺序。 主键：肽键 二硫键 一级结构是由遗传信息决定的。 一级结构是蛋白质空间结构的基础。 胰岛素的一级结构 二、蛋白质的二级结构 secondary structure （一）概念：多肽链主链的局部空间结构，不涉及氨基酸残基侧链的构象。 稳定因素：在肽键的羰基氧和亚氨氢之间形成的氢键。 （二）肽单元（peptide unit)： 参与组成肽键的6个原子（-C? -CO- NH- C?-)位于同一平面，又叫酰胺平面或肽键平面。它是蛋白质构象的基本结构单位。 肽单元结构特点： ①肽键的C—N键长介于单键和双键之间，具有部分双键性质，不能自由旋转。 ②肽键的-C=O和-N-H及两个C?均为反式构型。 ③与C?相连的单键可自由旋转， C?—C旋转角度以?（psi)表示， C? —N旋转角度以?表示，即两面角。这样，两个相邻肽单元可以围绕一个共用的C?自由旋转，而造成两个肽单元在空间的不同位置。这就是肽链折叠、盘曲的基础。 (三) 二级结构的主要构象形式 1. ?-螺旋 2. ?-折叠 3. ?-转角 4. 无规卷曲 ?-螺旋(?-helix) (1) ?-螺旋结构要点: ①多肽链主链围绕中心轴形成右手螺旋，侧链伸向螺旋外侧。 ② 每圈螺旋含3.6个氨基酸，螺距 为0.54nm。 ③ 每个肽键的亚氨氢和第四个肽 键的羰基氧形成的氢键保持螺 旋稳定。 ④ 氢键与螺旋长轴基本平行。 (2)影响?-螺旋形成的因素 ① 氨基酸侧链所带电荷 (如：酸 性或碱性氨基酸）Asp Glu , Arg Lys ② 氨基酸侧链的大小（如：Phe, Trp, Ile , Gly) ③ 氨基酸侧链的形状 (如：Pro) 2. ?-折叠结构（? －pleated sheet） ①多肽链充分伸展，相邻肽单元之间折叠成锯齿状结构，侧链位于锯齿结构的上下方。 ②两段以上的?-折叠结构平行排列 ，两链间可顺向平行，也可反向平行 。 ③两链间的肽键之间形成氢键， 以稳固?-折叠结构。氢键与 螺旋长轴垂直。 ?-折叠形成条件：要求氨基 酸侧链较小。 反向平行 顺向平行 ? 3. ?-转角 ( ?-turn) ① 肽链内形成180o回折。 ②含4个氨基酸残基，第一个氨基酸残基C=O与第四个氨基酸残基N－H形成键。 ③ 第二个氨基酸残基常Pro。 4. 无规卷曲 (random coil) 没有确定规律性的肽链结构。 （四）模序（motif） 概念：蛋白质分子中，两个或三 个具有二级结构的肽段， 在空间上相互接近，形成 一个具有特殊功能的空间 结构。 形式：βββ βαβ 螺旋-环-螺旋 螺旋-转角-螺旋 锌指 亮氨酸拉链 （五）分子伴侣 （chaperon） 概念：帮助新生多肽链正确折叠的一 类蛋白质。 作用： 1. 可逆地与未折叠肽段的疏水部分 结合，防止错误折叠。 2. 与错误折叠的肽段结合，诱导其 正确折叠。 3. 对蛋白质分子中二硫键的正确形 成起重要作用。 三、蛋白质的三级结构 ( tertiary structure) 概念：指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置，也就是整条肽链所有原子在三维空间的排布位置。 稳定因素： 非共价键：疏水键 氢键 盐键 Van der Waals力 共价键： 二硫键 氢键： 连在电负性强的半径小的原子上的H与另一个电负性强的原子之间的相互作用。 －C=O ﹉ H-O-H －C=O ﹉ H-N－ 盐键 ：正负离子间的静电引力。 带正电的基团： ? － NH3 ＋ Lys的ε－NH3 + ＋ His 的咪唑基 Arg 的胍基 带负电的基团： ?－COO- ASP 的β－COO- Glu的γ－COO- － NH3 ＋ ﹉ －OOC－ 疏水键： 疏水基团在水中避开水而聚集在一起的作用力。Ala, Leu, Ileu, Val, Trp, Pro