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[理学]第二章 蛋白质的构件—氨基酸.ppt
胱氨酸中的二硫键在稳定蛋白质的构象上起很大的作用。氧化剂和还原剂都可打开二硫键。如过甲酸和巯基化合物 磺基丙氨酸 胱氨酸 七、 氨基酸的旋光性和光谱性质 (一)氨基酸的旋光性和立体化学 α-氨基酸的α-碳是一个不对称碳(手性碳),不对称碳原子上的4个取代基在空间的取向可以有两种构型,D型和L型。氨基酸的构型以D性甘油醛为参考物。 除Gly外,19种氨基酸的α-碳原子都是不对称碳原子,因此至少有两种光学异构体。 Thr、Leu、Pro和羟Pro还有第二个不对称碳原子。 (二)氨基酸的光谱性质 分光光度法的原理是Lamber-Beer定律: A = log I0 /I = - log T = εcl T= I/I0 A: 吸光值(absorbance) (光密度, optical density,OD) ε: 摩尔吸收系数(摩尔消光系数) c: 摩尔浓度 l: 比色杯的内径或光程厚度 I0: 入射光强 I: 透射光强 T: 透光率 八、氨基酸混合物的分离和分析 (一)分配层析 层析 即色层分析也称色谱(chromatography)。 层析的种类有很多种如吸附层析,离子交换层析等。 分配层析依据的是分配定律。 分配定律(partition law):当一种物质在两种给定的互不相容的溶剂中分配时,在一定温度下达到平衡时,溶质在两相中的浓度比值为一常数,即分配系数(Kd)。 ? Kd = CA/CB CA和CB 分别是A相(流动相)、B相(固定相)中的浓度 某一物质在层析系统中的行为取决于有效分配系数 Keff = 某一物质在A相中的总量/某一物质在B相中的总量 ? 溶质的有效分配系数可以调整两项的体积比而加以改变。 ? 分配柱层析 纸层析 将支持剂(硅胶、纤维素粉等)涂布在玻璃板上制成均匀的薄层。 分辨率高,所需样品极微,层析速度快。 (一)离子交换层析 离子交换树脂是具有酸性或碱性基团的人工合成聚苯乙烯—苯二乙烯(polystyrenedivinylbenzene)等不溶性高分子化合物。聚苯乙烯—苯二乙烯是离子交换树脂的基质(matrix)。 阳离子交换树脂,如—SO3H(强酸型)或—COOH(弱酸型),对于在酸性环境中的氨基酸阳离子,它们可以和H+发生交换而“结合”在树脂上。 同样的阴离子交换树脂含有的碱性基团如—N(CH3)3OH(强碱型)或)—NH3OH(弱碱型)可解离出OH-能与溶液里的阴离子交换而结合在树脂上。 分离氨基酸混合物经常使用强酸性离子交换树脂。 氨基酸在树脂上的牢固程度,主要取决于他们之间的静电吸引,其次是氨基酸侧链与树脂基质聚苯乙烯之间的疏水作用。 在pH3左右,氨基酸与阳离子交换树脂之间的静电吸引力的大小次序是: 碱性氨基酸(A2+)>中性氨基酸(A+)>酸性氨基酸(A-)。 洗脱氨基酸的有效方法是 逐步提高洗脱剂的pH和盐浓度(离子强度)。 第二章 蛋白质的构件—氨基酸 一、 蛋白质的化学组成和分类? 化学组成: 碳 50% 氢 7% 氧 23% 氮 16% 硫 0-3% 其他 微量 ? 凯氏定氮法的基础: 蛋白质含量 = 蛋白氮 ×6.25 蛋白质的分类: 单纯蛋白质: 仅由氨基酸组成,如核糖核酸 酶,肌动蛋白。 缀合蛋白质: 除氨基酸外还其他化学成分作 为结构的一部分。称为 (辅基或配体) 酶、 调节蛋白、 转运蛋白、 贮存蛋白、 结构蛋白、等。 按生物功能分类: 二、 蛋白质的水解 蛋白质水解最后成为氨基酸混合物 酸水解 不产生消旋作用,得19种 L-AA,色氨酸破坏。 碱水解 多数氨基酸破坏(精氨酸脱氨、产 生尿素和鸟氨酸),产消旋现象。 酶水解 不消旋、不破坏,但水解不彻底。 三、 α-氨基酸的一般结构 19种氨基酸具有一级氨基(-NH3+)和羧基(-COOH)结合到α碳原子(Cα),同时结合到(Cα)上的是H原子和各种侧链(R);Pro具有二级氨基(α-亚氨基酸) α-氨基酸的结构通式: 不带电形式 H2N—Cα—H COOH R +H3N—Cα—H COO- R 两性离子形式 Cα如是不对称C(除Gly),则: 具有两种立体异构体 [D-型和L-型] 2. 具有旋光性 [左旋(-)或右旋(+)] 四氨基酸的分类 根据R的化学结构 (1)脂肪族氨基酸:1)中性氨基酸:Gly、Ala、Val、Leu、I
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