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DNA甲基化在转录起始发挥的作用演示教学.ppt
;表观遗传学
DNA甲基化
CpG岛
研究进展
;一、表观遗传学;;
; 现象3:
肿瘤抑制基因被过量地甲基化而导致失去活性,而基因的DNA序列并不发生变化。 ;基因;
什么是表观遗传学? ;表观遗传学研究对象; 二、 DNA甲基化
;DNA甲基化的概念及机理;DNA甲基化形成过程;;;;;DNA甲基化;CpG岛(CpG Island);用组蛋白Hl与含CCGG序列的甲基化和非甲基化DNA实验后发现:
甲基化达到一定程度时会发生从常规的B-DNA向Z-DNA的过渡。又由于Z-DNA结构收缩,螺旋加深,使许多蛋白质因子赖以结合的元件缩入大沟而不利于基因转录的起始。
DNA甲基化导致某些区域DNA构象变化,影响蛋白质与DNA的相互作用;抑制转录因子与启动区DNA的结合效率。
用序列相同但甲基化水平不同的DNA为材料,比较其作为RNA聚合酶转录模板的活性,发现甲基的引入不利于模板与RNA聚合酶的结合,降低了其体外转录活性。
5-甲基胞嘧啶在DNA上并不是随机分布的,基因的5端和3’端往往富含甲基化位点,而启动区DNA分子上的甲基化密度与基因转录受抑制的程度密切相关.
;CpG甲基化形成机制:
甲基化酶:
Dam甲基化酶:催化GATC中的A甲基化(原核)
Dcm甲基化酶:催化CCGG中2位C甲基化(原核,JM109,HB101)
真核生物甲基化酶:CpG的C形成5‘-甲基胞嘧啶
维持甲基化酶(maintenance DNA methyltransferase) (dnmt1) :在甲基化双链中只有亲代是甲基化的,而子代为非甲基化。此酶识别亲代甲基化位点,催化子代甲基化;对半甲基化的全甲基化催化效率非常高。一旦突变,导致全基因组去甲基化,引发胚胎死亡
重新甲基化酶(de novo DNA methyltransferase)(dnmt3a和dnmt3b):使没有甲基化的双链发生甲基化;使早期胚胎发生重新甲基化;dnmt3b突变引发着丝粒不稳定,面部畸形和致死性免疫缺陷。;CpG岛影响基因转录的机制
直接抑制转录复合物,如HAT(组蛋白乙酰化酶)、CA(辅助激活因子)、TF(基础转录因子);对甲基化敏感的TF有:AP-2,E2F,NFkB;不敏感的有Sp1。
基因表达时需要核小体松散、组蛋白乙酰化,这样可以吸引HAT、CA、TF等转录因子与DNA结合而启动转录。但CpG甲基化后,结合5-甲基胞嘧啶结合蛋白(如MBD1,MBD2,MBD3T,MBD4,Mecp2等,methylcytosine-binding domains),激发去乙酰化酶,组蛋白恢复正常,染色体结构改变而抑制基因表达。
有些情况下,组蛋白出现去乙酰化,使得重新甲基化酶与CpG结合,引发染色体结构变化和CpG甲基化,抑制基因表达。;DNA甲基化的研究进展
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