应用生物信息学数据挖掘技术分析花粉与柱头细胞识别过....docVIP

项目类别 项目编号 C 附件1 山东农业大学 国家大学生创新性实验计划项目 申报书 项目名称：应用生物信息学数据挖掘技术分析花粉与柱头细胞识别过程中的关键功能基因 申 请 人： 朱忠旭 学号： E—mail： sxzhuxu@126.com 联系电话： 所在学院： 生命科学学院 专业年级： 08 级 生物技术 专业 1 班 指导教师: 高新起 职称 副教授 申报日期： 2009 年 12 月 2 日 山东农业大学 大学生创新性实验计划管理委员会 一、简表 项 目 简 况 项目名称 应用生物信息学数据挖掘技术：分析花粉与柱头细胞识别过程中关键功能基因团 项目类别 A.实验设计类科技制作类科学类类 植物发育分子生物学与植物细胞信号转导的研究；植物授粉过程中花粉和柱头相互识别的分子机理以及细胞骨架参与的细胞信号转导机理863项目《小麦开花时间重要功能基因的鉴定及作用机理的研究》 项 目 组 主 要 成 员 ∧ 不 含 申 请 者 ∨ 姓 名 学号 性 别 出生年月 专业 年级 所在学院 学习 状况 项目中的 分工 签字 相星辰男 89-04-11 生物科学08级 生命科学学院 优秀 实验操作 刘仲祥男 90-12-08 生物技术08级 生命科学学院 优秀 数据处理 二、立项依据（项目的意义、现状分析） 粮食安全关系到我国社会稳定与经济发展的大局，是决定我国社会能否和谐发展的重要物质基础。种子是人类食物的主要来源，而种子的形成必须经过授粉这一关键过程，授粉的效率和质量对作物产量的形成起着至关重要的作用。其中，花粉与柱头之间的识别是至关重要的一步，对于完成受精起着决定性作用。随着生物技术、信息技术等新方法与农业科学常规方法的结合，使农业科学的研究手段日益更新和完善。生物芯片技术能高通量并行分析成千上万个基因表达，对基因表达、调控以及信号通路进行快捷、有效的分析，已成为分子生物学实验室中常规的实验技术。本研究课题的实施将遵守“三七”之道；即“三分技术”、“七分数据”，最重要的是要解决生物学问题的原则。对植物发育中花粉与柱头识别的相关基因表达关系进行系统研究。首先使用生物信息学方法，整合花粉与柱头识别过程中所有已研究出的理论和数据；然后，采用基于miRNA和mRNA基因芯片表达谱数据的知识获取与数据挖掘技术，分析花粉与柱头识别过程中关键功能基因，着重于植物花粉与柱头细胞识别的基因调控机制，构建其基因调控网络模型；再进一步研究基因调控网络模型的“自组织、自适应、特异性”。 本项目所研究的基因调控网络模型不仅有助于解释和预测授粉发育中的生命现象,并且为传统的研究方法开辟了一条基于数据驱动的新途径,即通过对数据的分析处理,获得新的假说,进而继续指导研究的方向，为相关学科课题组提供基于生物信息学分析的研究新思路和途径。因此，通过本项目的实施，将对于理解授粉过程中花粉与柱头识别的分子机理有极为重要的科学意义，对于农业生产上利用栽培技术措施调控配子体的正常发育和授粉有着十分重要的指导意义。 在植物授粉过程中，雄配子体与柱头、花柱等雌性细胞的识别都严格地受到许多基因的调控，这些基因通过在不同时空上的特异表达实现其对花粉萌发、花粉管定向生长、雌雄配子体识别等一系列重要生命过程的精确控制。被子植物双受精的识别发生在花粉粒与柱头、花粉管与花柱及雌雄配子体之间，任何一个部位不能识别都会导致生殖障碍。其中花粉与柱头之间，更确切的说是花粉壁与柱头间的作用是识别的第一步，也是至关重要的一步，对于完成受精起着决定性作用。花粉传到柱头上以后，很快就开始了识别作用，被柱头认可的亲和花粉，即吸水萌发，产生花粉管。因此，花粉与柱头细胞的识别是植物完成有性生殖的关键环节[1] 。 对于具有干柱头的植物，如拟南芥、玉米，花粉粒在柱头表面的选择性吸附对于区分不同种属间的花粉是非常重要的一步。第一步花粉粘附只跟花粉粒外壁相关，跟花粉粒外壳的脂类和蛋白质无关，但是，研究表明第一步花粉黏附与孢粉素有关[2]。花粉与柱头的交联紧跟其后，因为当花粉黏附在柱头表面时，花粉壳变得可以移动，使得花粉与柱头表面紧密接触。来自于花粉和柱头的脂类、糖类和蛋白在接触的界面相互混合，它们之间的相互作用为交联产生黏附力。蛋白酶处理影响这一步的正常发生表明蛋白质在这个过程起重要作用[3] 。SLR1属于S-位点相关蛋白的多基因家族，被认为在花粉和柱头相互作用过程中起重要作用，研究结果发现SLR1影响种内、