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多种.植物总DNA提取方法及详细步骤
植物总DNA提取
一、常用方法
改良CTAB法(改良自精编分子生物学实验指南,原蓝猪耳实验方案,拟采用) 植物基因工程,王关林,2002 SDS法(植物基因工程,王关林,2002) 高盐低pH值法(邹喻萍,植物学报,1994) 材料预处理:℃的黑暗中饥饿1~2d,以消耗淀粉和其他多糖。材料预处理:℃的黑暗中饥饿1~2d,以消耗淀粉和其他多糖。材料预处理:℃的黑暗中饥饿1~2d,以消耗淀粉和其他多糖。材料预处理:℃的黑暗中饥饿1~2d,以消耗淀粉和其他多糖。 试剂:
2-巯基乙醇(2-ME)
CTAB抽提液
CTAB/ NaCl溶液
24:1(V/V)氯仿/异戊醇
CTAB沉淀液
高盐TE缓冲液
70%乙醇
TE缓冲液 试剂:
2×CTAB提取缓冲液试剂:
提取缓冲液:100mmol/L Tris·Cl(pH8.0)、50mmol/L EDTA(pH8.0)、500 mmol/L NaCl、10 mmol/L 2-巯基乙醇(2-ME)
10% SDS
5mol/L KAC 操作:将冻粉转入2ml离心管中l(980+20)预热至65℃的CTAB抽提液,于65 ℃温育10~60 min),并经常温和混匀。
放至室温,加入等体积的氯仿异戊24:1)抽提匀浆液,颠倒使充分混合,℃,7 500g(对于小样品,在离心机上以10000 /min)离心1/10体积的65℃的CTAB/Nal溶液,颠倒混匀。氯仿异戊24:1),颠倒使充分混合,℃,7 500g(对于小样品,在离心机上以10000 /min)离心CTAB沉淀液,混匀,如果沉淀可见,继续做,否则于65 ℃温育30 min℃,10000 r/min离心l的高盐TE缓冲液和2μl RNaseA储备液重悬沉淀,于37℃温育30min。
加入2倍体积预冷的无水乙醇,充分混匀,于4℃, 7 500g(对于小样品,在离心机上以10000 /min)l TE溶解沉淀。
操作:
2ml离心管中加入1ml提取缓冲液,65℃预热。0.2g新鲜幼嫩叶片,于液氮中迅速研磨成粉。将呈干粉状态的研磨物迅速转入提取缓冲液中,尽快混匀,于65℃保温30min。其间轻柔2~3次。取出离心管,冷至室温,加入1ml的氯仿/异戊醇,轻缓颠倒混匀,静置10min。10 000r/min离心10 min。转移上清液于另一离心管中,加入2/3体积的异丙醇,轻缓颠倒混匀,室温放置15min。10 000r/min离心10 min,去上清液。用2ml 70%乙醇洗涤沉淀次,室温下微干,μl 高盐TE缓冲液 μl的RNase,颠倒混匀,37℃保温h。4℃, 7 500g(对于小样品,在离心机上以10000 /min)l TE溶解沉淀。
操作:
称取样品0.g,去除表面的DNA污染,置于研钵中与液氮共研成细粉。将冻粉转入2ml离心管中,加入提取缓冲液μl(自注:观察此用量合适否),轻轻搅动,使冻粉充分散开。加入400μl 10%SDS,充分混匀,于65℃水浴中保温10~15min(间隔晃动2~3次)。加入640μl 5 mol/L KAC,充分混匀,冰浴中放置30min。4℃ 12 000rpm离心15min。上清液转入新的离心管中,加入等体积的氯仿/异戊醇,轻轻颠倒离心管数次,放置。于4℃下8 000rpm离心10min。上清液转入离心管中,加入2/3体积、-20℃预冷的异丙醇,混匀,放置30min,观察DNA沉淀生成。于4℃下8 000rpm离心10min,去上清液。用80%的乙醇洗涤沉淀,10~15min。加入400μl TE缓冲液充分溶解沉淀(若溶解不好,可置37℃水浴中保温,促进溶解)。5 000rpm离心5min,上清液转入新的离心管(去除不溶物)。加入10μl RNaseA溶液(1μg/μl),于37℃温育30min。加入等体积的氯仿/异戊醇,,放置后10 000rpm离心5min,重复一次。转移并量出上清液体积,置新离心管中,加入1/5体积的3 mol/L NaAC,混匀,加入2.5倍体积的无水乙醇,轻缓混匀,室温放置。10 000rpm离心5~10min,去上清。用80%乙醇洗涤沉淀2~3次,。加入50μl 溶解DNA,备用。 称取样品,去除表面的DNA污染,置于研钵中与液氮共研成细粉℃的提取缓冲液,保温30min,并经常温和混匀(自注:观察时间够否,提取液够否)。
在室温下10 000g离心10min。
上清液中加入2/3体积2.5mol/L pH4.8的KAc溶液,0℃放置30min沉淀蛋白质。
10 000g,4℃离心10min。
上清液加入0.6倍体积-20℃预冷的异丙醇-20℃放置30min使核酸充分沉淀。
10 000g离心10min,去上清,将沉淀溶于500μl SDDW中。10 000g离心min,
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