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16RNA合成的生物合成和加工.ppt
转录单位 一个转录事件从起始点到终止点的DNA区间。 上游顺序:转录起始点左边的DNA顺序。 下游顺序:转录起始点右边的DNA顺序,转录起始点相应的DNA碱基对记为+1。 -10区和-35区:是大肠杆菌启动子结合的部位,通常在不同的细菌中具有相似性。 启动子:被RNA聚合酶识别、结合并开始转录的模板DNA的部位,称为启动子(promoter)。 Pribnow盒:大肠杆菌和其他相关细菌的绝大多数启动子中,-10区的交感顺序,具有5′TATAAT3′特征。 一、大肠杆菌的RNA聚合酶 核酶的发现,对中心法则作了重要补充; 核酶的发现是对传统酶学的挑战; 利用核酶的结构设计合成人工核酶。 逆转录病毒的生活周期蠖 端粒合成的一种模型 碱基修饰 (2)还原反应 如:U ? DHU (3)核苷内的转位反应 如:U ? ψ (4)脱氨反应 如:A ? I 如:A ? Am (1)甲基化 (1) (1) (3) (2) (4) 第六节 核 酶 具有酶促催化活性的RNA称为核酶。 核酶(ribozyme) 核酶研究的意义 不依赖于ρ因子的终止:这类终止子结构上有2个特征 (2)发夹结构末端紧跟6个连续的U,这 发夹结构阻碍了聚合酶的进一步延 伸,RNA链的合成就终止,酶和 mRNA就从模板DNA上释放。 (1)DNA链的3′端附近有回文结构,富含G-C碱基,随后紧跟的是A-T碱基, 转录而形成的RNA具有茎环的发夹形结构(hairpin structure) 。 依赖ρ因子(rho factor)的终止:ρ因子是ρ基因编码的蛋白质,是一种酶,它具有ATPase的活性和解链酶的活性,在水解ATP的情况下,它沿着5′→3′方向转录物的3′端前进,直到遇到暂停在终止点位置的RNA聚合酶。随后ρ因子通过解链酶的活性解开转录泡(transcription bubble)上的RNA/DNA形成的杂交双螺旋,使RNA转录物得到释放,从而终止转录。 5? 3? DNA 原核生物转录过程中的羽毛状现象 核糖体 RNA RNA聚合酶 第四节 真核生物与原核生物转录的主要区别 1. 真核细胞RNApol种类较多,根据它们对α-鹅膏蕈碱的敏感性不同分为RNA pol I 、II 、III, 它们是高度分工的,不同的RNA聚合酶负责合成不同 的RNA。 2. 真核启动子比原核启动子更复杂和更多样性,不同的RNA聚合酶有不同的启动子。 3. 原核细胞靠RNA pol本身可识别启动子,而真核细胞的RNApol无法识别启动子,要靠转录因子 (transcription factor,TF)识别启动子 ,有许多转录因子。 4. 原核细胞基因转录的产物大多数为多顺反子mRNA,这是由于原核转录系统中功能相关的基因共享一个启动子,它们在转录时,以一个共同的转录单位进行转录。而真核 细胞,每一种蛋白质的基因都有自己独立的启动子,所以真核细胞转录产物是单顺反子mRNA。 原核 真核 DNA A B C P 转录 mRNA A B C DNA P A P B P C 转录 mRNA A B C 5. 原核细胞是边转录、边翻译,两个过程几乎是同时进行的,而真核细胞转录和翻译在时间上和空间上都是分开的,转录在细胞核,翻译在细胞质。 6. 真核细胞中DNA与组蛋白结合在一起,形成染色质,后者进一步盘曲、折叠形成染色体,其中只有一小部分能转录。 7. 真核细胞被转录的产物要经过非常复杂的后加工。 8、原核生物RNA聚合酶可以被利福霉素和利链霉素抑制,真核生物RNA聚合酶被α-鹅膏蕈碱抑制。 第五节 新生RNA的剪接和修饰 RNA前体 (初级转录产物) 加工(断裂、修剪、修饰) 成熟RNA 真核细胞最初转录的产物是核内不均一RNA(HnRNA),是mRNA的前体。 HnRNA分子量不均一,大小不同,沉降常数20s~100s,组成上类似于DNA(类似于DNA的RNA,D-RNA),代谢很快,迅速合成和降解。 HnRNA分子很大,其中大约只有10%转变成mRNA,其余在转录后的加工过程中被降解掉。 一、mRNA前体的加工过程 原核细胞的mRNA通常没有转录后的加工过程。 (1)戴帽 (2)加尾 (3)剪接(splicing) (4)修饰:主要是链内腺苷的甲基化 1、HnRNA转变成mRNA的加工过程包括 (1)戴帽 (2)加尾 (3)剪接(splicing) pG-OH (ppG-OH, pppG-OH) U-OH GpU pGpA 第一次转酯反应 第二次转酯反应 UpA GpU 外显子1 内含子 外显子2 G-OH UpU pGpA 二、rRNA前体的加工过程:
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