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* * * 新学科多如繁星,学科交叉逐渐细化深化,但是生物化学无疑是生命科学领域的基础的基础,生物化学的基础就是我们的化学。 * * * * 开始生物化学之旅之前,先对构成生命的化学基础——分子的类别及其在生命单元细胞中占的比重由一个估计,英文名词我会考,让我们先记住这些随后会让我们惊心动魄、叹为观止的平凡而又伟大的名字 * * 1958-1965年中国科学家完成该51氨基酸蛋白的全合成,具有生理活性。1955年西方科学家因为合成一种8肽激素而获得诺贝尔化学奖,第一个蛋白的三维晶体结构是肌红蛋白 * * * * * * * * 不同的命名和分类系统代表了不同的研究角度和方法,只有互相配合,相互补充,才能全面描述自然 * * * * * 第二节 多肽 五、多肽的化学合成(自学) 1、氨基酸的常用保护方法; 2、肽键的形成方法; 3、多肽的固相合成; 4、组合合成法合成多肽; 第三节 蛋白质的结构 由一条或多条多肽链以特殊方式结合而成的生物大分子;分子量在6000 Da(道尔顿)以上的多肽称为蛋白质。分子量变化很大:6,000~1000,000 Da或者更大。 第三节 蛋白质的结构——纯化分离方法 离子交换 Ion-exchange 体积排阻 Size-exclusion 亲和色谱 Affinity 第三节 蛋白质的结构 一、蛋白质的一级结构——组成蛋白质的多肽链数目,多肽链的氨基酸顺序,多肽链内或链间二硫键的数目和位置。 1953年英国的F. Sanger测定其一维结构,获1958年诺贝尔化学奖 第三节 蛋白质的结构 一、蛋白质的一级结构 1、一级结构测定;(自学) 2、多肽链氨基酸顺序分析——Edman降解;(自学) 3、蛋白质一级结构的生物学意义: 是蛋白质生理功能的基础,影响高级结构和相应的生理功能。 氨基酸顺序由核酸的遗传信息——基因决定,基因突变(gene mutation)技术是研究蛋白质氨基酸顺序与生物功能关系的重要方法。(关联——第三章和第四章) 基因组学和蛋白组学。 第三节 蛋白质的结构 二、蛋白质的二级结构——肽链主链折叠产生的有规则几何走向,只涉及肽链主链的构象及链内或链间的氢键。 决定肽链主链构象和空间排列的主要因素:肽键平面的二面角和氢键 第三节 蛋白质的结构 二、蛋白质的二级结构 1、a-螺旋——右手方向盘绕成螺旋,螺距:0.54 nm,含3.6个氨基酸;第一个氨基酸残基的酰胺基团的羰基与第四个氨基酸残基酰胺基团的氨基形成肽链内氢键,该氢键的取向与螺旋轴方向几乎平行; Linus Carl Pauling 第三节 蛋白质的结构 二、蛋白质的二级结构 2、b-折叠——两条或多条几乎完全伸展的肽链平行排列,通过链间的氢键交联而形成的。肽链的主链呈锯齿状折叠构象;结构牢固,又分成平行和反平行两种形式。 3、b-转角——四个氨基酸组成的不很稳定的环状结构,可以使肽链在蛋白中的走向多次逆转; 第三节 蛋白质的结构 二、蛋白质的二级结构 普通型 甘氨酸(第三个)型 4、无规则卷曲——紧密环(compact loop):6-16个氨基酸残基组成;通过疏水作用或形成氢键等成为紧密结构,可能与蛋白质的识别功能有关,参与催化作用; 第三节 蛋白质的结构 二、蛋白质的二级结构 4、无规则卷曲——连接条带:伸展的肽链条带构成二级结构单元之间的连接;其主链的羰基和氨基间一般不形成氢键,常位于蛋白质分子表面,能与介质水分子形成氢键; 连接条带 第三节 蛋白质的结构 二、蛋白质的二级结构 蛋白质的三级结构是指在二级结构的基础上,肽链在空间上进一步盘绕、折叠形成的包括主链和侧链构象在内的特征的三维结构。维系这种特定结构的力主要有:氢键、疏水键、离子键和范德华力等。尤其是疏水键。 1、超二级结构:相邻的二级结构单元按照一定规律、规则地组合在一起,彼此相互作用,形成在空间构象上有区别的二级结构组合单位,称为超二级结构; 第三节 蛋白质的结构 三、蛋白质的三级结构 2、三级结构的折叠类型 (1)全a-类型 第三节 蛋白质的结构 三、蛋白质的三级结构 2、三级结构的折叠类型 (2)平行a/b-类型 第三节 蛋白质的结构 三、蛋白质的三级结构 2、三级结构的折叠类型 (3)反平行b-类型 第三节 蛋白质的结构 三、蛋白质的三级结构 2、三级结构的折叠类型 (4)不规则结构类型 第三节 蛋白质的结构 三、蛋白质的三级结构 蛋白质的四级结构是指由多条各自具有一、二、三级结构的肽链(亚基)通过非共价键连接起来的结构形式,各个亚基在这些蛋白质中的空间排列方式及亚基之间的相互作用关系。 1、寡聚蛋白的亚基
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