小尾寒羊5个与繁殖和疾病抗性相关基因的克隆及比较基因组学分析-动物遗传育种与繁殖专业论文.docx

从GenBank绵羊z粥15mRNA参照序列(NM_001009735．1)的474bp延．长至525bp，编码氨基酸残 基的个数也从GenBank的参照序列NP_001009735．1的157个氨基酸残基变为174个氨基酸残基， 3-UTR也相应地缩短为19bp。济宁青山羊的ISGl50RF为402bp，编码133个氨基酸残基。1SGl5的启动子区分析显示该基因为无TAlA盒启动子，除犬DPE出现于mRNA的+4l～+45bp外．多物种 ISGl5的DPE均以(GTGA)AGATG的形式出现于+23—·27。小尾寒羊和济宁青山羊的DNA预测 出的蛋白由于DNA序列中存在的碱基插入或(和)缺失的现象，使其ISGl55白C末端结构并不 存在Leu-Arg-Leu-Arg-Gly-Gly(LRLRGG)序列。绵羊基因组中TLR9以单拷贝形式出现，基因克隆产物长4192 bp，包括115 bD的5，-UTR、2个Exon和44bp的3’-UTR。小尾寒羊TLR9经基因预测后，与其他哺乳动物TLR9mRNA的相似性分 别为，牛96％，猪87％，马86％．猫85％，犬85％，人83％，黑猩猩83％，恒河猴83％，大鼠78％， 小鼠77％，和负鼠70％。TLR9蛋白与其他各物种的相似性分别为，牛95％，猪85％，马83％。猫 84％，犬83％。人79％，黑猩猩79％，恒河猴79％，大鼠72％，小鼠73％，和负鼠60％。多物种TLR9 蛋白功能域在数量、种类及相对位置上均有不同，因而造成恒河猴和小鼠在多物种TLR9蛋白功 能域聚类分析与基因的系统进化树的聚类的位置上存在差异。绵羊基因组dPMSY2以单拷贝形式出现，基因克隆产物长4927 bp，包括外显子2~8和493 bp的 3-UTR，在绵羊的精于和卵子发生过程中．MsY2可能在基因转录、RNAt§定性和RNA的翻泽调 控中发挥重要作用。CIBI基因组扩增产物为3Kb．包括7个外显子及50bp的5’．unt和189bp的3-UTR。CIBl 皋丸eDNA扩增产物799 bp，ORF为576bp．编码191个氨基酸。多物种CIBl非常保守，绵羊 与其他物种的CIBl mRNA序列一致性分别为与牛为98％．犬95％，人、恒河猴、大鼠和小鼠均 为93％。CIBl蛋白分子量为21．7kDa，等电点为4．36，具有与其它哺乳动物相同的EF-hand结构域，与其他物种的相似性分别为，牛97％，犬和恒河猴87％，人88％，大鼠和小鼠85％。关键词 绵羊比较基因组学繁殖性状相关基因疾病抗性相关基因基因克隆】B，^，GTLR9MSY2 CIBlIIAbstractAs an important renewable resource in the world，sheep holds the important station in agricultural production．In case of The Human，Chicken，Cow and Pig Genome Initial Sequencing already having been completed，the research on sheep genome presents obvious laggard status．Based on tools of comparative genomies，the information from model organisms can be used to confer quantities， positions，function，and expression model and species evolution ofgenes in domestic animal and poultryvariety．So important economical character candidate genes can be appraised，cloned and gottencharacteristic．We attempt to induct the tools of comparative genomics on Innction genome study of Chinese local sheep variety to clone sheep reproduction and the disease resistance correlation genes，inorder to provide the theory basis for local sheep variety breeding or resources conservation，and instruct the sheep