微生物学 NO13 微生物的进化、系统发育和分类鉴定.pptVIP

3．电子杂交 随着微生物基因信息，特别是全基因组完全 测序的不断增加，我们可以通过各种计算机 软件对不同物种的遗传信息进行直接比较， 从而分析不同微生物间的亲缘关系。 四、其它 血清学试验、噬菌体分型、生态特性、氨基 酸顺序和蛋白质分析、对细胞壁等细胞成分 的分析比较、通过原核生物的转化、转 导、接合来判断原核生物的亲缘关系等等。 血清学试验 （凝集反应） 噬菌体分型 通过氨基酸顺序判断细菌间的亲缘关系 第四节 伯杰氏手册 《伯杰氏鉴定细菌学手册》 (Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology) 美国宾夕法尼亚大学的细菌学教授伯杰(D.Bergey)(1860-1937) 1957年第七版后，由于越来越广泛地吸收了国际上细菌 分类学家参加编写(如1974年第八版，撰稿人多达130多位 ，涉及15个国家；现行版本撰稿人多达300多人，涉及近 20个国家)，所以它的近代版本反映了出版年代细菌分类学 的最新成果，因而逐渐确立了在国际上对细菌进行全面分 类的权威地位。 《伯杰氏系统细菌学手册》 (Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology) 伯杰氏手册是目前进行细菌分类、鉴定的最重要 依据，其特点是描述非常详细，包括对细菌各个属 种的特征及进行鉴定所需做的实验的具体方法。 （20世纪80年代末期） 1. 为什么能用生物大分子作为衡量生物进化的标尺？有哪些选用原 则？建立16 S r RNA系统发育树的意义何在？ 2. 为什么在现代微生物分类中，任何能稳定地反映微生物种类特征 的资料，都有分类学意义，都可以作为分类鉴定的依据？你知道 有哪些项目已被用于细菌学分类和鉴定？ 思考题 * 一、分类单元及其等级 界 门 纲 目 科 属 种 根据Carl Woese的 理论，现在还在界 之上使用域(domain) （把全部生物先分为 古生菌域、细菌域和 真核生物域，域下面再分界。） 常用的细菌分类学术语： 1）培养物(culture)：一定时间一定空间内微生物的细胞群 或生长物。如微生物的斜面培养物、摇瓶培养物等。 2）菌株(strain)：从自然界中分离得到的任何一种微生物的纯培养 物都可以称为微生物的一个菌株；用实验方法(如通过诱变) 所获得的某一菌株的变异型，也可以称为一个新的菌株， 以便与原来的菌株相区别。 菌株是微生物分类和研究工作中最基础的操作实体 Bacillus subtilisASI.398 Bacillus subtilisBF7658 生产蛋白酶 生产α淀粉酶 3）型(form或type):常指亚种以下的细分。当同种或同亚种不同菌 株之间的性状差异，不足以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。 例如抗原特征的差异分为不同的血清型；对噬菌体裂解反应的 不同分为不同的噬菌型等 4）种（species）:物种，生物分类中基本的分类单元和分类等级。 高等生物中，“生殖隔离”被看作是区分物种的标准 微生物的种：具有高度特征相似性的菌株群，这个菌株群与其 他类群的菌株有很明显的区别。 二、微生物的命名 双名法，由二个拉丁字或希腊字或拉丁化了的其它文字组成， 一般用斜体表示 属名在前，一般用拉丁字名词表示，字首字母大写 种名在后，常用拉丁文形容词表示，全部小写 若所分离的菌株只鉴定到属，而未鉴定到种，可用sp.来表示， 例如 Bacillus sp. 由于细菌分类单元的划分缺乏一个易于操作的统一标准， 为了减少因采用不同标准界定分类单元所造成的混乱， 细菌系统分类也像其他生物分类一样采用“模式概念” 种和亚种指定模式菌株（type strain）； 亚属和属指定模式种（type species）； 属以上至目级分类单元指定模式属（type genus）； 模式菌株应送交菌种保藏机构保藏，以便备查考和索取。 第三节、细菌分类鉴定的特征和技术 形态学特征、 生理学特征、 生态学特征 从不同层次(细胞的、分子的)，用不同学科(化学、物理学、 遗传学、免疫学、分子生物学等)的技术方法来研究和比较 不同微生物的细胞、细胞组分或代谢产物，从中发现的反 映微生物类群特征的资料。 生物分类的传统指标： 一、形态学特征 培养特征、 运动性、 特殊的细胞结构、 细胞形态及其染色特性、 等等 微生物分类和鉴定的重要依据之一： a）易于观察和比较，尤其是真核微生物和具有特殊 形态结构的细菌； b）许多形态学特征依赖于多基因的表达，具有相对 的稳定性； 二、生理生化特征 与微生物的酶和调节蛋白质的本质和活性直接相关； 代谢产物等 营养类型； 与氧的关系； 对温度