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第二章核酸的分子结构、性质和功能 导 学 掌握核酸的分子组成和一级结构概念;DNA双螺旋结构要点;碱基配对规则;维持双螺旋结构稳定的主要因。 掌握分子杂交概念;杂交与复性的区别 熟悉核酸的理化性质和各类RNA的结构特点 了解DNA的三级结构;反义核酸;RNAi;病毒核酸。 教学内容 第一节 DNA的结构与功能 第二节 RNA的结构与功能 第三节 核酸的分子杂交 第四节 反义核酸与药物 第五节 RNAi 第六节 病毒核酸 第一节 DNA的结构与功能 一、 DNA的一级结构与种属的差异 (一)DNA的一级结构 由dAMP、dGMP、dCMP、dTMP四种脱氧核苷酸通过3’,5’-磷酸二酯键按一定顺序排列而成的高分子化合物。 即:DNA分子中脱氧核苷酸残基的排列顺序 由于核苷酸间的差异主要是碱基不同,所以也称为碱基序列。 意义:一级结构蕴藏了遗传信息,决定了DNA的二级结构和空间结构。 核酸的基本组成单位:核苷酸 主要组成元素:C、H、O、N、P P平均含量:9%~10% 核苷酸的组成 戊 糖 碱 基 磷 酸 核苷(脱氧核苷)和磷酸以磷酸酯键连接形成核苷酸(脱氧核苷酸)。 核苷酸的分子结构 核酸的连接方式 单核苷酸之间的连接键:3?, 5? -磷酸二酯键 核酸链的二个游离末端: 5?磷酸基末端 3?羟基末端 书写方向: 5? ? 3? 核苷酸之间以磷酸二酯键连接形成多核苷酸链,即核酸。 RNA和DNA的组成 RNA和DNA的分布及功能 核苷酸或脱氧核苷酸 5’-核苷酸又可按其在5’位缩合的磷酸基的多少,分为一磷酸核苷(核苷酸)、二磷酸核苷和三磷酸核苷。 体内重要的游离核苷酸及其衍生物 多磷酸核苷酸:NMP,NDP,NTP 环化核苷酸: cAMP,cGMP 含核苷酸的生物活性物质: NAD+、NADP+、CoA-SH、FAD 等都含有 AMP cAMP cGMP (二)DNA的一级结构与种属的差异 DNA一级结构的不同是物种差异的根本原因。 不同种属的DNA碱基组成不同,排列顺序不同 genus(种属)由gene变来(基因一词是英语“gene”的音译,是“开始”、“生育”的意思。它源于印欧语系),类似的还有genius(天才)等诸多词汇。 DNA分子中只有生物种属和个体的差异性,无组织器官间的差异性 DNA分子不因个体的生长发育、营养状况、环境条件的改变而改变 C值的概念:一个单倍体基因组的DNA 含量总是恒定的,它通常称为该物种DNA 的C值(C value)。 随着生物的进化,生物体的结构与功能越来越复杂,需要的基因产物种类也越来越多,即C值就越大。 二、DNA的二级结构 ---------双螺旋模型 DNA的二级结构是 指两条脱氧多核苷酸链 反向平行盘绕所形成的 双螺旋结构。 DNA双螺旋结构特点 1、DNA分子由两条相互平行但走向相反的脱氧多核苷酸链,围绕同一中心轴以右手螺旋方式构成一个双螺旋形状。 2、疏水的碱基平面层叠于螺旋的内部,亲水的脱氧核糖-磷酸以磷酸二酯键相连形成的骨架位于螺旋的外侧。 3、碱基平面与螺旋轴垂直,核糖平面与螺旋轴平行,两条链间存在碱基互补:A与T或G与C配对形成氢键,称为碱基互补原则(A与T为两个氢键,G与C为三个氢键); (三)稳定双螺旋结构的因素 ①碱基堆积力形成疏水环境(主要因素) 。 ②碱基配对的氢键。GC含量越多,越稳定。 ③磷酸基上的负电荷与介质中的阳离子或组蛋白的正离子之间形成离子键,中和了磷酸基上的负电荷间的斥力,有助于DNA稳定。 ④碱基分子内能。碱基处于双螺旋内部的疏水环境中,可免受水溶性活性小分子的攻击。 (1)?? B—DNA:典型的Watson-Crick双螺旋DNA 右手双螺旋 每圈螺旋10.4个碱基对 螺距:3.32nm (2)? A-DNA 右手双螺旋,外形粗短。 RNA-RNA、RNA-DNA杂交分子 具有这种结构。 (3)Z-DNA 左手螺旋,外形细长。 天然B-DNA的局部区域可以形成Z-DNA。 三、DNA的三级结构 正超螺旋(positive supercoil) 盘绕方向与DNA双螺旋方同相同 ,结果加大了DNA分子内部张力,有紧旋效应。 负超螺旋(negative supercoil) 盘绕方向与DNA双螺旋方向相反,旋转结果使DNA分子内部张力减小,称为松旋效应。在自然条件下共价封闭环状DNA呈负超螺旋结构。 ①超螺旋形式是DNA分子
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