PCR的原理操作步骤.pptVIP

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PCR的基本原理、操作步骤、注意事项及临床应用 济宁医学院附属医院检验科 贾印峰 聚合酶链反应 聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR),是一种对特定的DNA片段在体外进行快速扩增的方法。通过体外扩增,可以将目的基因(或靶基因)片段百万倍地放大,从而极大地提高核酸分子检测的灵敏度,理论上其检测的灵敏度可以达到一个细胞甚至一个分子水平。 一、PCR的基本原理  PCR技术的基本原理 类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成:①模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备;②模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;③引物的延伸:DNA模板--引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA 链互补的半保留复制链。重复循环变性--退火--延伸三过程,就可获得更多的“半保留复制链”,而且这种新链又可成为下次循环的模板。每完成一个循环需2~4分钟, 2~3小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。 1. PCR反应体系: DNA 聚合酶          DNA 靶序列          两端引物          脱氧核苷酸 dNTPs          缓冲液 2. DNA的合成方向 5’ 3’ 3. Taq DNA聚合酶的作用 4. PCR循环: 变性         退火         延伸 PCR 循环 第一步 - 变性 (93~98℃) ①模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备; PCR循环 第二步 - 退火 (37~65℃) ②模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合; PCR循环 第三步 - 延伸 (70~75℃) ③引物的延伸:DNA模板--引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA 链互补的半保留复制链。 第一个 PCR 循环 - 靶序列完成复制 实时荧光定量PCR原理 ?实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。 荧光定量PCR原理 一个重要概念 ???? Ct 值的定义 ????在荧光定量PCR技术中,有一个很重要的概念 —— Ct值。C代表Cycle,t代表threshold,Ct值的含义是:每个反应管内的荧光信号到达设定的域值时所经历的最小循环数(如下图所示)。 Ct值的意义 Ct值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系 我科开展的PCR检验项目 乙 肝 病 毒(HBV-DNA) 丙 肝 病 毒(HCV-RNA) 结 核 杆 菌(TB-DNA) 肺 炎 支 原 体(MP-DNA) 淋 球 菌(NG-DNA) 沙 眼 衣 原 体(CT-DNA) 解 脲 支 原 体(UU-DNA) 单纯疱疹病毒Ⅱ型 (HSV Ⅱ -DNA) 乳头瘤病毒6,11型 (HPV6,11-DNA) EB 病 毒(EB-DNA) 巨细胞病毒(CMV-DNA) 标本的采集、验收和保存 1 标本的采集 a)血液标本:用真空采集管采集血液标本,血标本采集后在2小时内(检验单与标本一道)送达实验室(HCV采用EDTA抗凝的血浆)。离心后用一次性吸管吸取血清或血浆加入经高压灭菌的1.5ml的离心管中,输入病人基本信息,编号。 b)痰标本:用带盖的无菌一次性塑料瓶收集清晨肺深部痰标本送检。(对于无痰或少痰的患者,可用45℃加温的100g/L NaCl水溶液雾化吸入或改变体位以使痰液易于咳出;对于小儿可以轻压胸骨柄上方以诱导咳痰,用消毒棉拭子刺激喉部引起咳嗽反射,用棉拭子采集标本。)标本在室温下保存不能超过24小时。 c)生殖道拭子:尿道或阴道分泌物由医生用专用取样拭子(灭菌,一次性)采集样本,及时送检。采集生殖道拭子标本,要求病人在采样前2小时内不能排尿,采样时,将棉拭子伸入男性尿道及女性宫颈口2~3cm,转动

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