生物信息学课件 3.4基因组序列分析(石).pptVIP

3.4 基因组序列分析 引言 基因组序列分析步骤 基因组序列分析结果评价 核苷酸关联分析 MatLab生物信息学平台下几个用于核苷酸序列统计的函数 引言 1.DNA序列分析(DNA sequence analysis)主要包括： (1)序列比较； (2)寻找基因及其表达调控信息。 2.如何寻找基因： (1)识别特殊序列信号； (2)预测基因的编码区域。 3.4.1 基因组序列分析步骤 1.DNA序列分析的重点：对基因和功能位点 进行分析或预测。 2.一个基本的DNA序列分析方案 (实际应用中，需根据不同的要求进行不同的处理，不存在通用的序列分析方法。） 1.识别“功能序列”和“非功能序列”的过程 3.4.3 核苷酸关联分析 1.每种核苷酸出现频率 (3)距离为k的两联核苷酸关联性分析 3.4.4 MatLab生物信息学平台下几个用于核苷酸序列统计的函数 1.basecount(count nucleotides in a sequence) 例：bases = basecount(TAGCTGGCCAAGCGAGCTTG) 答案： bases = A: 4 C: 5 G: 7