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基于SSR标记玉米群体豫综5号遗传多样性分析
基于SSR标记的玉米群体豫综5号遗传多样性分析
摘要以玉米群体豫综5号轮回选择改良群体的6个世代为材料,通过SSR标记技术对豫综5号群体的6个世代的多态性位点比例、位点的平均杂合度、遗传距离以及基因频率和基因型种类等进行了比较分析,结果表明豫综5号经过改良后,群体仍具有丰富的遗传多样性。
关键词玉米群体;SSR;遗传多样性;豫综5号
中图分类号S513;Q78文献标识码A文章编号 1007-5739(2011)11-0107-03
GeneticDiversityAnalysisonMaizePopulationsYuSyn5BasedonSSRMarker
ZHANG Li 1YUE Jing-zhi 1ZHANG Chun-rong 1LI Jia-fu 1SUN Mi-ping 1XIAO Xing-zhong 1JIA Bao-hua 1
HAO Ling-ling 1CHEN Yan-hui 2
(1 Jiyuan Institute of Agricultural Sciences in Henan Province,Jiyuan Henan 459000; 2Agronomy College of Henan Agricultural University)
AbstractUsing six generations materials by recurrent selection of YuSyn5 as the basic materials,the proportion of polymorphic loci,the average locus heterozygosity,genetic distance,and the types of gene frequencies and genotypes of YuSyn5 were analyzed by SSR method. The results showed that YuSyn5 still had a wealth of genetic diversity by comprehensive improved.
Key wordsmaize population;SSR;genetic diversity;YuSyn5
我国玉米育种难以取得突破性进展的重要原因是种质遗传基础狭窄,解决玉米种质基础狭窄问题的唯一途径是种质扩增、改良与创新[1-4]。研究不同群体遗传组成和多样性及其群体间的遗传关系,对于种质改良创新和合理利用具有十分重要的意义[5-7]。
河南农业大学在1990年由16个美国种质来源的自交系组配而成豫综5号群体,经过3轮的半姊妹轮回选择、1轮相互半姊妹轮回选择和1轮混合选择等方法进行改良。目前已有的研究和育种实践证明:该育种群体增产潜力大,具有较高利用价值。河南农业大学、新疆农业科学院、四川农业大学等单位先后从该改良群体中选育出优良自交系,并在生产上得到广泛应用,并组配出了多个通过审定的新品种。
为进一步改良和利用玉米的群体改良提供理论依据,该研究利用SSR标记分析技术初步分析其遗传特点,对玉米群体豫综5号不同轮次群体多态性位点的平均杂合度、遗传距离、位点比例以及基因型频率和种类等群体遗传结构进行研究,比较3种方法改良后不同轮次群体基因频率等遗传多样性变化规律。
1材料与方法
1.1试验材料
试验以豫综5号的C1、C2、C3、C4、M5等5轮改良的群体和C0群体作为材料,并选用塘四平头、Reid、旅大红骨和P群的自交系B73、齐319、Lancaster、掖478、黄早4、Mo17、丹340,共6个代表国内主要杂优类群的自交系作为试验对照。
1.2样品DNA提取
全部材料在田间种植,植株长6~7片叶时,从对照自交系中各取6个单株,从豫综5号群体的不同世代各取100个单株,采摘幼嫩叶于-80 ℃冰箱保存。自交系按6个单株叶片混合,豫综5号按单株叶片,采用改良CTAB法提取DNA。
1.3SSR扩增
均匀分布在玉米10条染色体上的100对SSR引物,由MaizeGDB中随机初步选择,由上海生工合成,再通过电泳从中筛选出35对引物用于试验,要求多态性高、带型好(表1)。这些引物基本上在玉米10对染色体上平均分布,每条染色体约3对引物。
PCR扩增反应总体积为15 μL,包括0.5 mmoL/L dNTP 0.3 μL,10×buffer(含MgCl2)1.5 μL,10 ng/μL引物1.5 μL,ddH2O 8.6 μL,1 U Taq酶0.1 μL,模板DNA 3.0 μL。
采用PTC-200扩
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