合江棘蛙paa robertingericathelicidin家族抗菌肽的基因克隆 结构与生物功能研究-study on the gene cloning structure and biological function of paa robertingericathacidin family antimicrobial peptides from rana hejiangensis.docx
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HYPERLINK \l _bookmark0 6 抗氧化活性 48
HYPERLINK \l _bookmark1 第四节 结果与分析 48
HYPERLINK \l _bookmark2 1 抗菌活性 48
HYPERLINK \l _bookmark3 2 溶血活性 51
HYPERLINK \l _bookmark4 3 红细胞凝集活性 51
HYPERLINK \l _bookmark5 4 DPPH 自由基清除活性 52
HYPERLINK \l _bookmark6 总 结 54
HYPERLINK \l _bookmark7 讨 论 55
HYPERLINK \l _bookmark8 本研究创新点 60
HYPERLINK \l _bookmark9 参考文献 61
HYPERLINK \l _bookmark10 攻读学位期间发表的论文 69
HYPERLINK \l _bookmark11 致 谢 70
贵州师范
贵州师范大学硕士学位论文
摘要
摘 要
合江棘蛙(Paa robertingeri)(Anura: Ranidae)为蛙科棘蛙属物种, 仅分布于云贵高原的四川、云南和重庆等少数地区,属中国特有种, 其数量稀少,保护级别为濒危。Cathelicidin 抗菌肽是一种特殊的抗菌 肽大家族,由保守的 N-端信号肽区域,高度保守的“cathelin”间隔肽 区域和高度特异的 C-末端成熟肽区域组成,经酶切作用释放出成熟 肽。成熟肽在大多数脊椎动物的先天性免疫系统中发挥着重要作用, 作为抵抗病原菌入侵和抵御其他外界伤害的第一道防线。目前几乎在 所有脊椎动物,包括人、哺乳类、鸟类、爬行类和鱼类中均有发现, 但在两栖类中关于 cathelicidin 的报道极少,仅在棕点湍蛙(Amolops loloensis)、脆皮大头蛙(Limnonectes fragilis)、双团棘胸蛙(Paa yunnanensis)、牛蛙(Rana catesbeiana)和红瘰疣螈(Tylototriton verrucosus)体内有报道 cathelicidins 抗菌肽。在本论文中,对合江棘 蛙 cathelicidins 抗菌肽进行了结构、功能等初步研究。
从合江棘蛙皮肤组织提取总 RNA,构建了皮肤 cDNA 文库,根 据 cathelicidin 家族基因序列特征设计引物,使用半巢氏 PCR 的方法, 克隆到了两条编码 cathelicidins 前体的 cDNA 序列,经过分析比对, 推断出两条成熟肽序列:cathelicidin-PR1 和 cathelicidin-PR2,分别由
29 个( RKCNLFCKAKQKLKSLSSVIGTVVHPPRG )和 25 个
(KECKDYLCKLLMKLGSSSHIESIDP)氨基酸残基组成。进化分析 发现,合江棘蛙 cathelicidins 与双团棘胸蛙 cathelicidin 有很高的同源 性,两者在进化过程中亲缘关系最近,与物种分类吻合。合江棘蛙与 其他两栖类蛙科动物 cathelicidins 独立成一簇,与哺乳类、爬行类、鸟 类、鱼类来源的 cathelicidins 相互独立,与物种进化顺序略有不同, 为 cathelicidins 基因家族起源和进化提供了证据。
Cathelicidin-PR1 和 cathelicidin-PR2 分子量均非常小,分别为 3195.88Da 和 2838.34Da,两者各有一条二硫键,圆二色谱检测显示 两者在无菌水溶液中均为无规则卷曲结构的二级结构,而在拟膜环境 的 SDS 溶液(60mM)中主要呈 α-螺旋结构,与理论预测结构相近,
I
II
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这种结构对发挥杀菌作用发挥着重要作用。
在供试的 13 株细菌和真菌中(含标准菌株和临床分离的耐药菌 株),化学合成的 cathelicidin-PR1 对大部分菌株均出现杀菌作用, 对 6 种菌(含细菌和真菌)显示较强抗性,特别是对临床分离的耐药 菌株,其最小抑菌浓度(MIC)可达到 11.73 μM;而 cathelicidin-PR2 则未检测到任何抗菌活性。杀菌动力学显示,在 5 倍 MIC 浓度时, cathelicidin-PR1 可在 45 min 内杀死临床分离蜡样芽孢杆菌,较氨苄 西林快(需 1.5 h 以上)。两者的溶血活性都极低,在浓度 100 μg/ml 时,cathelicidin-PR1 与 cathelicidin-PR2 溶血率分别为 3.87%、1.12%; 将浓度提高到 200 μg/ml 时,溶血率分别为 1.78%和 2.01%,充分说 明两者无溶血活性。红细胞凝集实验结果显示在无 Ca2
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